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目的 探讨长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)人肺腺癌转移相关转录本1 (metastasis associated in lung denocarcinoma transcript 1,MALAT1)对早产儿高氧肺损伤的保护作用.方法 从基因表达数据库GEO(gene expression omnibus)下载芯片数据集GSE25286(Affymetrix Mouse Genome 4302.0 Array),依据高氧暴露与否,比较14 d、29 d的小鼠正常肺组织和高氧肺损伤的肺组织MALAT1 mRNA的表达.从GEO中下载芯片数据集GSE43830(Human Exon 1.0 ST Arrays),在WI 38细胞(肺成纤维细胞)中敲除MALAT1后和未敲除MALAT1的WI38细胞中,用反义RNA技术检测比较多种基因如细胞分裂周期蛋白6(cell division cycle 6,CDC6)、死亡效应结构域蛋白2(death effector domain containing 2,DEDD2)及细胞周期蛋白Cyclin B1(CCNB1)的表达变化.同时,收集早产儿外周血标本验证,2015年1月至2016年12月在我院NICU住院治疗的高氧肺损伤早产儿20例为试验组,无高氧肺损伤的20例早产儿为对照组,采集40例早产儿末梢外周血,抽提RNA,逆转录后进行Real time-PCR检测40例早产儿外周血MALAT1的表达,收集并分析40例早产儿的一般临床资料.结果(1)通过使用软件对芯片源文件进行预处理和差异表达基因筛选,从最终的差异表达基因中发现, lncRNA MALAT1

作者:蔡成;龚小慧;裘刚;邱家俊;张潇月;刘洁敏;楚晓云

来源:中国小儿急救医学 2017 年 24卷 10期

知识库介绍

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蔡成;龚小慧;裘刚;邱家俊;张潇月;刘洁敏;楚晓云
来源:
中国小儿急救医学 2017 年 24卷 10期
标签:
长链非编码RNA 新生儿 肺损伤 人肺腺癌转移相关转录本1 高浓度氧 Long noncoding RNA Neonates Lung injury Metastasis associated in lung denocar-cinoma transcript 1 Hyperoxia
目的 探讨长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)人肺腺癌转移相关转录本1 (metastasis associated in lung denocarcinoma transcript 1,MALAT1)对早产儿高氧肺损伤的保护作用.方法 从基因表达数据库GEO(gene expression omnibus)下载芯片数据集GSE25286(Affymetrix Mouse Genome 4302.0 Array),依据高氧暴露与否,比较14 d、29 d的小鼠正常肺组织和高氧肺损伤的肺组织MALAT1 mRNA的表达.从GEO中下载芯片数据集GSE43830(Human Exon 1.0 ST Arrays),在WI 38细胞(肺成纤维细胞)中敲除MALAT1后和未敲除MALAT1的WI38细胞中,用反义RNA技术检测比较多种基因如细胞分裂周期蛋白6(cell division cycle 6,CDC6)、死亡效应结构域蛋白2(death effector domain containing 2,DEDD2)及细胞周期蛋白Cyclin B1(CCNB1)的表达变化.同时,收集早产儿外周血标本验证,2015年1月至2016年12月在我院NICU住院治疗的高氧肺损伤早产儿20例为试验组,无高氧肺损伤的20例早产儿为对照组,采集40例早产儿末梢外周血,抽提RNA,逆转录后进行Real time-PCR检测40例早产儿外周血MALAT1的表达,收集并分析40例早产儿的一般临床资料.结果(1)通过使用软件对芯片源文件进行预处理和差异表达基因筛选,从最终的差异表达基因中发现, lncRNA MALAT1