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目的:分析新疆细粒棘球蚴AgB1、AgB2、AgB4蛋白的氨基酸序列,了解其蛋白二级结构特点,预测抗原表位,为包虫病的进一步免疫学诊断和研究提供理论支持。方法利用生物信息分析软件 DNAstar分析3种抗原的蛋白二级结构特点,运用在线软件 IEDB对3种抗原各参数进行综合分析并预测其抗原表位。结果EgAgB1、EgAgB2和 EgAgB4分别是由78、90、91个氨基酸残基组成的不同多肽。其蛋白质二级结构中均有α-螺旋、β-折叠、转角区域和卷曲区域。综合分析各参数推测 EgAgB1具有2个抗原表位,分别是14~23位氨基酸残基(DDGLTSTSRS)、37~42位氨基酸残基(RDPLGQ)。推测 EgAgB2的2个抗原表位分别为41~49位氨基酸残基(DFFRNDPLG)、83~90位氨基酸残基(EEKDDDSk)。EgAgB4可能含有的2个抗原表位分别是43~50位氨基酸残基(RSDPLGQR)、84~89位氨基酸残基(EEEDDS)。结论采用生物信息技术对新疆细粒棘球蚴 AgB1、AgB2、AgB4进行B细胞表位特点的研究和分析,对更准确诊断包虫病具有重要意义。

作者:安梦婷;吾拉木·马木提;马海梅;张峰波;王红英;赵慧;丁剑冰

来源:新疆医科大学学报 2016 年 39卷 12期

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作者:
安梦婷;吾拉木·马木提;马海梅;张峰波;王红英;赵慧;丁剑冰
来源:
新疆医科大学学报 2016 年 39卷 12期
标签:
细粒棘球蚴 AgB 生物信息技术 B细胞表位 Echinococcus granulosus AgB bioinformatics B cell epitope
目的:分析新疆细粒棘球蚴AgB1、AgB2、AgB4蛋白的氨基酸序列,了解其蛋白二级结构特点,预测抗原表位,为包虫病的进一步免疫学诊断和研究提供理论支持。方法利用生物信息分析软件 DNAstar分析3种抗原的蛋白二级结构特点,运用在线软件 IEDB对3种抗原各参数进行综合分析并预测其抗原表位。结果EgAgB1、EgAgB2和 EgAgB4分别是由78、90、91个氨基酸残基组成的不同多肽。其蛋白质二级结构中均有α-螺旋、β-折叠、转角区域和卷曲区域。综合分析各参数推测 EgAgB1具有2个抗原表位,分别是14~23位氨基酸残基(DDGLTSTSRS)、37~42位氨基酸残基(RDPLGQ)。推测 EgAgB2的2个抗原表位分别为41~49位氨基酸残基(DFFRNDPLG)、83~90位氨基酸残基(EEKDDDSk)。EgAgB4可能含有的2个抗原表位分别是43~50位氨基酸残基(RSDPLGQR)、84~89位氨基酸残基(EEEDDS)。结论采用生物信息技术对新疆细粒棘球蚴 AgB1、AgB2、AgB4进行B细胞表位特点的研究和分析,对更准确诊断包虫病具有重要意义。