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目的 探讨结核病患者血清差异表达环状RNA(circRNA)的筛选.方法 收集肺结核患者(病例组)及健康对照者(对照组)各3例,利用表达谱芯片将病例组和对照组的全血circRNA进行检测并筛选差异表达的circRNA,将circRNA的差异基因通过基因本体(GO)富集分析和信号通路的显著性分析筛选出结核病差异基因.结果 本研究发现3 000个上调circRNA,2 484个下调circRNA.具备差异特性的circRNA 835个(P<0.05),其中上调的circRNA 249个,下调的circRNA 586个.G()富集分析表明差异基因主要富集在突触间隙中乙酰胆碱分解代谢过程、对水浸抑制应力酸受体信号通路、受体循环调节、细胞外基质分解等生物学过程.信号通路的显著性分析表明差异基因主要参与阿尔茨海默氏病、子宫内膜癌、甲状腺癌、结核、噬菌体、系统性红斑狼疮、FcγR介导的吞噬作用等信号通路调节.结论 结核病患者血清中存在差异表达的circRNA,差异circRNA通过其靶基因参与多个生物学过程和信号通路调节.

作者:张迪;赵辉;王家路

来源:新疆医科大学学报 2020 年 43卷 4期

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作者:
张迪;赵辉;王家路
来源:
新疆医科大学学报 2020 年 43卷 4期
标签:
结核病 信号通路 差异基因
目的 探讨结核病患者血清差异表达环状RNA(circRNA)的筛选.方法 收集肺结核患者(病例组)及健康对照者(对照组)各3例,利用表达谱芯片将病例组和对照组的全血circRNA进行检测并筛选差异表达的circRNA,将circRNA的差异基因通过基因本体(GO)富集分析和信号通路的显著性分析筛选出结核病差异基因.结果 本研究发现3 000个上调circRNA,2 484个下调circRNA.具备差异特性的circRNA 835个(P<0.05),其中上调的circRNA 249个,下调的circRNA 586个.G()富集分析表明差异基因主要富集在突触间隙中乙酰胆碱分解代谢过程、对水浸抑制应力酸受体信号通路、受体循环调节、细胞外基质分解等生物学过程.信号通路的显著性分析表明差异基因主要参与阿尔茨海默氏病、子宫内膜癌、甲状腺癌、结核、噬菌体、系统性红斑狼疮、FcγR介导的吞噬作用等信号通路调节.结论 结核病患者血清中存在差异表达的circRNA,差异circRNA通过其靶基因参与多个生物学过程和信号通路调节.