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目的 通过mRNA高通量测序探讨脓毒症患者转为脓毒症休克的分子机制.方法 选择2019年6月—2021年6月在新疆医科大学第四附属医院急诊科住院诊断为脓毒症患者70例作为研究对象,根据随访患者病情及预后,分为脓毒症休克组、脓毒症非休克组,每组35例.分析两组一般情况、感染指标方面的差异,通过Illumina测序平台,每组选取10例患者外周全血样本进行mRNA转录组测序,分析筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行基因本体(gene ontology,GO)及基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库富集分析,经蛋白质网络互作分析,筛选关键基因,进一步扩大样本至测序例数的两倍,并采取实时荧光定量检测(qPCR)法进行验证.结果 两组一般情况中年龄、体重比较,差异无统计学意义(P>0.05);两组白细胞介素-6、降钙素原、C-反应蛋白比较,差异具有统计学意义(P<0.05);通过筛选共获得28543个差异基因(P<0.05),其中下调基因1126个,上调基因1053个;差异基因分析结果显示,排名前十的STAT1、MYD88及JUN2均为Toll样受体信号通路(toll like receptors,TLRs)相关基因;GO及KEGG富集分析发现,NOD样受体信号通路、TLRs信号通路、RIG-1样受体信号通路等与脓毒症的发生、发展相关;对TLRs信号通路进行蛋白质网络互作分析,筛

作者:林爽;白永江;马骏麒

来源:新疆医科大学学报 2021 年 44卷 12期

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作者:
林爽;白永江;马骏麒
来源:
新疆医科大学学报 2021 年 44卷 12期
标签:
TLRs样受体家族;脓毒症休克;基因测序
目的 通过mRNA高通量测序探讨脓毒症患者转为脓毒症休克的分子机制.方法 选择2019年6月—2021年6月在新疆医科大学第四附属医院急诊科住院诊断为脓毒症患者70例作为研究对象,根据随访患者病情及预后,分为脓毒症休克组、脓毒症非休克组,每组35例.分析两组一般情况、感染指标方面的差异,通过Illumina测序平台,每组选取10例患者外周全血样本进行mRNA转录组测序,分析筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行基因本体(gene ontology,GO)及基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库富集分析,经蛋白质网络互作分析,筛选关键基因,进一步扩大样本至测序例数的两倍,并采取实时荧光定量检测(qPCR)法进行验证.结果 两组一般情况中年龄、体重比较,差异无统计学意义(P>0.05);两组白细胞介素-6、降钙素原、C-反应蛋白比较,差异具有统计学意义(P<0.05);通过筛选共获得28543个差异基因(P<0.05),其中下调基因1126个,上调基因1053个;差异基因分析结果显示,排名前十的STAT1、MYD88及JUN2均为Toll样受体信号通路(toll like receptors,TLRs)相关基因;GO及KEGG富集分析发现,NOD样受体信号通路、TLRs信号通路、RIG-1样受体信号通路等与脓毒症的发生、发展相关;对TLRs信号通路进行蛋白质网络互作分析,筛