目的 了解新德里金属β-内酰胺酶1(NDM-1)的氨基酸组成、理化性质、二三级结构和系统进化等,为进一步研究其作用机制和生物学功能奠定基础.方法 利用Compute pI/MW、ProtParam、SOPMA等生物信息学方法,对NDM-1进行分析.结果 NDM-1的等电点为5.07,疏水性GRAVY值为0.107;二级结构存在螺旋、折叠和转角等,没有信号肽和跨膜区域;三级结构由3个α-螺旋和4个β-折叠片组成;属于Family Lactamase_B (PF00753)蛋白质家族;其基因序列与海洋细菌(Erythrobacter litoralis) HTCC2594的β-内酰胺酶Ⅱ基因同源性最近.结论 NDM-1可能起源于环境,通过基因水平转移被传递给临床致病菌,并在抗生素的选择压力下,成为威胁人类健康的全球性问题.
作者:叶皓;周永君;黄国娇;殷建华
来源:西南国防医药 2012 年 22卷 11期