目的 分析田鼠巴贝虫3-磷酸甘油醛脱氢酶(BmGAPDH)的蛋白特性和抗原表位.方法 运用ORF Finder、PROSITE、ProtParam、SignalP、TMHMM Server、SOUSI、MotifScan、Bcepred、HNN等生物信息学软件分析预测BmGAPDH基因的开放阅读框和编码蛋白的特征结构域、理化性质、信号肽、跨膜结构域、稳定性、可溶性、翻译后修饰位点、亲水性、柔韧性、表面可及性、二级结构等特性;同时结合DNAStar和SWISS-MODEL软件分别预测蛋白的抗原表位和三维空间结构.结果 BmGAPDH由1074个核苷酸编码的357个氨基酸组成,其特征结构域位于170-177位氨基酸残基.编码蛋白相对分子质量为3.833309×104,分子式为C1700H2723N457O514S17,理论等电点为6.98,不存在信号肽,有1个跨膜区,23个翻译后修饰位点,6个亲水性参数得分≥1.9的区域,3个柔韧性参数得分≥2.0的区域,10个表面可及性参数得分≥1.9的区域,8个潜在的B细胞抗原表位,19个潜在的T细胞抗原表位,在溶液中性质稳定,且为疏水性蛋白.BmGAPDH蛋白和人类的GAPDH蛋白序列覆盖率为56
作者：李会琴；陈泽天；郑辰；闫红茹；付琳琳；郑葵阳；刘相叶
来源：徐州医科大学学报 2017 年 37卷 9期
