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非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是一种高发病率和高死亡率的疾病,其预后和药物治疗效果存在个体化差异.因此,了解肺癌发生和发展的分子机制可以有效提高早期诊断和治疗,改善患者预后.巨噬细胞具有高度可塑性和异质性,是肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)中发挥抗肿瘤作用的关键细胞之一,在肿瘤发生发展过程中起着复杂的作用.为了阐明 NSCLC 中肿瘤相关巨噬细胞(tumor-associated macrophages,TAMs)相关基因在肺癌中的发生机制,本研究采用转录组测序、单因素COX回归、LASSO回归、多因素 COX 回归分析方法,筛选出与预后最相关的 11 个基因(FCRLA、LDHA、LMOD3、MAP3K8、NT5E、PDGFB、S100P、SFXN1、TDRD1、TFAP2A、TUBB6).计算风险评分(risk score,RS),根据RS中位数将所有样本分为高风险组和低风险组,并采用CIBERSORT反卷积算法验证RS及 11 个基因与巨噬细胞的相关性.上述结果表明,本研究所建立的风险评分可用于非小细胞肺癌患者预后预测,还可评估患者的免疫浸润状态,为后续肿瘤免疫治疗及基因靶向治疗提供参考.

作者:孙清玙;周阳;杜丽娟;张梦珂;王家乐;任媛媛;刘芳

来源:遗传 2023 年 45卷 8期

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孙清玙;周阳;杜丽娟;张梦珂;王家乐;任媛媛;刘芳
来源:
遗传 2023 年 45卷 8期
标签:
非小细胞肺癌 肿瘤微环境 肿瘤相关巨噬细胞 关键基因 non-small cell lung cancer tumor microenvironment tumor-associated macrophages key gene
非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是一种高发病率和高死亡率的疾病,其预后和药物治疗效果存在个体化差异.因此,了解肺癌发生和发展的分子机制可以有效提高早期诊断和治疗,改善患者预后.巨噬细胞具有高度可塑性和异质性,是肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)中发挥抗肿瘤作用的关键细胞之一,在肿瘤发生发展过程中起着复杂的作用.为了阐明 NSCLC 中肿瘤相关巨噬细胞(tumor-associated macrophages,TAMs)相关基因在肺癌中的发生机制,本研究采用转录组测序、单因素COX回归、LASSO回归、多因素 COX 回归分析方法,筛选出与预后最相关的 11 个基因(FCRLA、LDHA、LMOD3、MAP3K8、NT5E、PDGFB、S100P、SFXN1、TDRD1、TFAP2A、TUBB6).计算风险评分(risk score,RS),根据RS中位数将所有样本分为高风险组和低风险组,并采用CIBERSORT反卷积算法验证RS及 11 个基因与巨噬细胞的相关性.上述结果表明,本研究所建立的风险评分可用于非小细胞肺癌患者预后预测,还可评估患者的免疫浸润状态,为后续肿瘤免疫治疗及基因靶向治疗提供参考.