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目的 克隆药用真菌猪苓Polyporus umbellatus凋亡抑制因子基因BI-1并进行生物信息学和表达模式分析.方法 利用5,-RACE PCR方法获取基因cDNA全长;利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域和跨膜结构等分子特性;采用Bioeditor以及MEGA 6.0分别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析;实时荧光定量PCR分析基因表达模式.结果 猪苓细胞凋亡抑制因子BI-1(Genebank登录号JQ693683)的cDNA全长为1 091 bp,其中编码区占1 005 bp,编码334个氨基酸,推测相对分子质量为36 170,理论等电点为10.51,定名为PuBI-1.整个多肽链具5个疏水区,表现为疏水性,是疏水性蛋白.系统进化树结果显示PuBI-1所在分支隶属于担子菌群,与裂褶菌形成一单系.PuBI-1基因转录本在初始期和生长期表达量在菌核组织中显著高于未形成菌核的菌丝组织,分别为原基期菌核(SI)为3.8倍、发育期菌核(SD)为7.497倍,成熟期菌核和菌丝中的PuBI-1基因的表达量几乎无差异.结论 猪苓凋亡抑制因子基因BI-1的分子特征及表达模式为进一步研究其在猪苓菌丝形成菌核过程中的作用奠定理论基础.

作者:刘蒙蒙;宋超;邢咏梅;郭顺星

来源:中草药 2015 年 46卷 22期

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作者:
刘蒙蒙;宋超;邢咏梅;郭顺星
来源:
中草药 2015 年 46卷 22期
标签:
猪苓 药用真菌 细胞凋亡抑制因子 基因克隆 表达分析 实时荧光定量PCR Polyporus umbellatus (Pers.) Fries medicinal fungus Bax inhibitor-1 gene gene cloning expression analysis quantitative real-time PCR
目的 克隆药用真菌猪苓Polyporus umbellatus凋亡抑制因子基因BI-1并进行生物信息学和表达模式分析.方法 利用5,-RACE PCR方法获取基因cDNA全长;利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域和跨膜结构等分子特性;采用Bioeditor以及MEGA 6.0分别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析;实时荧光定量PCR分析基因表达模式.结果 猪苓细胞凋亡抑制因子BI-1(Genebank登录号JQ693683)的cDNA全长为1 091 bp,其中编码区占1 005 bp,编码334个氨基酸,推测相对分子质量为36 170,理论等电点为10.51,定名为PuBI-1.整个多肽链具5个疏水区,表现为疏水性,是疏水性蛋白.系统进化树结果显示PuBI-1所在分支隶属于担子菌群,与裂褶菌形成一单系.PuBI-1基因转录本在初始期和生长期表达量在菌核组织中显著高于未形成菌核的菌丝组织,分别为原基期菌核(SI)为3.8倍、发育期菌核(SD)为7.497倍,成熟期菌核和菌丝中的PuBI-1基因的表达量几乎无差异.结论 猪苓凋亡抑制因子基因BI-1的分子特征及表达模式为进一步研究其在猪苓菌丝形成菌核过程中的作用奠定理论基础.