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目的 克隆茶树WRKY转录因子(CsWRKYs)家族中的8个成员,并对其进行生物信息学和非生物胁迫下的表达分析.方法 采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术从“铁观音”茶树品种中克隆8个WRKY基因,运用生物信息学的方法对8个WRKY基因编码的蛋白进行理化性质分析,同时通过与拟南芥同源基因的比较进行进化树的构建、多序列比对及保守基序分析.采用qRT-PCR方法检测8个WRKY基因在低温、干旱和脱落酸(abscisic acid,ABA)胁迫处理下的表达量.结果 8个WRKY转录因子基因开放阅读框(ORF)长度分别为1 407、2 208、1 302、849、978、879、1 443和810bp,分别编码468、735、433、282、325、292、480和269个氨基酸,GenBank登录号分别为MG298951、MG298952、MG298955、MG298956、MG298957、MG298959、MG298960和MG298963.系统进化树及序列比对分析显示,8个CsWRKYs可以分成了2个大组;除CsWRKY39缺少锌指结构外,其他CsWRKYs均含有WRKYGQK保守七肽结构域及锌指结构组成的WRKY结构域.非生物胁迫下的表达模式显示,CsWRKYs基因在低温、干旱和ABA胁迫处理下均有表达且表达受到不同程度的诱导;CsWRKY2、CsWRKY21、CsWRKY23、CsWRKY44和CsWRKY65基因在低温处理后表达量上调超过2,显著响应低温胁迫;CsWRKY21、CsWRKY23、CsWRKY39和CsWRKY65在

作者:王鹏杰;陈笛;林浥;郑知临;郑玉成;杨江帆;岳川;叶乃兴

来源:中草药 2019 年 50卷 3期

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作者:
王鹏杰;陈笛;林浥;郑知临;郑玉成;杨江帆;岳川;叶乃兴
来源:
中草药 2019 年 50卷 3期
标签:
茶树 WRKY转录因子 克隆 生物信息学 非生物胁迫
目的 克隆茶树WRKY转录因子(CsWRKYs)家族中的8个成员,并对其进行生物信息学和非生物胁迫下的表达分析.方法 采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术从“铁观音”茶树品种中克隆8个WRKY基因,运用生物信息学的方法对8个WRKY基因编码的蛋白进行理化性质分析,同时通过与拟南芥同源基因的比较进行进化树的构建、多序列比对及保守基序分析.采用qRT-PCR方法检测8个WRKY基因在低温、干旱和脱落酸(abscisic acid,ABA)胁迫处理下的表达量.结果 8个WRKY转录因子基因开放阅读框(ORF)长度分别为1 407、2 208、1 302、849、978、879、1 443和810bp,分别编码468、735、433、282、325、292、480和269个氨基酸,GenBank登录号分别为MG298951、MG298952、MG298955、MG298956、MG298957、MG298959、MG298960和MG298963.系统进化树及序列比对分析显示,8个CsWRKYs可以分成了2个大组;除CsWRKY39缺少锌指结构外,其他CsWRKYs均含有WRKYGQK保守七肽结构域及锌指结构组成的WRKY结构域.非生物胁迫下的表达模式显示,CsWRKYs基因在低温、干旱和ABA胁迫处理下均有表达且表达受到不同程度的诱导;CsWRKY2、CsWRKY21、CsWRKY23、CsWRKY44和CsWRKY65基因在低温处理后表达量上调超过2,显著响应低温胁迫;CsWRKY21、CsWRKY23、CsWRKY39和CsWRKY65在