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目的:利用心肌肥大病理过程中基因表达谱的变化,构建基因/蛋白质调控网络.方法:以苯肾上腺素诱导新生大鼠心肌细胞肥大为模型,在分析肥大心肌细胞基因表达谱变化的基础上,进一步利用Pathwaystudio和Agilent Literature Search软件结合文献挖掘方法,构建基因/蛋白质相互作用网络.结果:构建的网络包含450个相互作用的基因/蛋白质(节点)以及592个它们之间相互作用的关系(边).拓扑分析表明该网络具有无尺度特性,同时分析确定14个基因/蛋白质是网络的关键节点.通过GO (gene ontology)分析,发现在苯肾上腺素诱导新生大鼠心肌细胞肥大的过程中,与物质代谢、细胞信号转导及细胞骨架等密切相关的基因可能发挥了重要作用.结论:构建基因/蛋白质网络为研究心肌肥大的分子机制提供了有用的信息和方法.

作者:张永新;李子健;闫洁;张幼怡

来源:中国病理生理杂志 2009 年 25卷 11期

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作者:
张永新;李子健;闫洁;张幼怡
来源:
中国病理生理杂志 2009 年 25卷 11期
标签:
心脏 心肌肥大 基因表达谱 Heart Myocardial hypertrophy Gene expression profiling
目的:利用心肌肥大病理过程中基因表达谱的变化,构建基因/蛋白质调控网络.方法:以苯肾上腺素诱导新生大鼠心肌细胞肥大为模型,在分析肥大心肌细胞基因表达谱变化的基础上,进一步利用Pathwaystudio和Agilent Literature Search软件结合文献挖掘方法,构建基因/蛋白质相互作用网络.结果:构建的网络包含450个相互作用的基因/蛋白质(节点)以及592个它们之间相互作用的关系(边).拓扑分析表明该网络具有无尺度特性,同时分析确定14个基因/蛋白质是网络的关键节点.通过GO (gene ontology)分析,发现在苯肾上腺素诱导新生大鼠心肌细胞肥大的过程中,与物质代谢、细胞信号转导及细胞骨架等密切相关的基因可能发挥了重要作用.结论:构建基因/蛋白质网络为研究心肌肥大的分子机制提供了有用的信息和方法.