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[目的]基于网络药理学和分子对接研究钩藤治疗动脉粥样硬化的有效成分、靶点及通路.[方法]利用TCMSP数据库并结合筛选条件,确定钩藤的主要有效成分和有效成分相应的靶点,构建有效成分-靶点网络;利用GeneCards、DisGeNET、OMIM及TTD数据库确定动脉粥样硬化的疾病靶点,获取药物靶点与疾病靶点的交集,并对交集靶点进行PPI网络分析、GO生物功能富集分析和KEGG通路富集分析,应用Cytoscape 3.9.0软件中的"Analyze Network"工具,构建有效成分-靶点-通路网络,筛选出核心成分、核心靶点、核心通路,并对核心成分与核心靶点之间的亲和力进行分子对接验证.[结果]筛选出33种有效成分,其中一种有效成分没有相应的靶点,筛选出1 608个疾病靶点和115个药物与疾病的交集靶点.PPI分析得到的主要靶点为AKT1、TNF、IL-6、IL-1β、TP53、JUN、CASP3、MMP9、PTGS2等.GO生物功能富集分析获得生物过程条目22个、细胞成分条目57个、分子功能条目100个.KEGG通路富集分析筛选出20条信号通路,主要为脂质和动脉粥样硬化、MAPK、癌症信号通路等."Analyze Network"工具构建的有效成分-靶点-通路网络,筛选出钩藤治疗动脉粥样硬化的核心成分为槲皮素、山奈酚;核心靶点为PTGS2、HSP90AA1、PTGS1;核心通路为脂质和动脉粥样硬化、MAPK信号通路.

作者:王彤;蓝青;马官迪;雷谊宁;张又枝

来源:中国动脉硬化杂志 2023 年 31卷 2期

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作者:
王彤;蓝青;马官迪;雷谊宁;张又枝
来源:
中国动脉硬化杂志 2023 年 31卷 2期
标签:
动脉粥样硬化 钩藤 网络药理学 分子对接 作用机制
[目的]基于网络药理学和分子对接研究钩藤治疗动脉粥样硬化的有效成分、靶点及通路.[方法]利用TCMSP数据库并结合筛选条件,确定钩藤的主要有效成分和有效成分相应的靶点,构建有效成分-靶点网络;利用GeneCards、DisGeNET、OMIM及TTD数据库确定动脉粥样硬化的疾病靶点,获取药物靶点与疾病靶点的交集,并对交集靶点进行PPI网络分析、GO生物功能富集分析和KEGG通路富集分析,应用Cytoscape 3.9.0软件中的"Analyze Network"工具,构建有效成分-靶点-通路网络,筛选出核心成分、核心靶点、核心通路,并对核心成分与核心靶点之间的亲和力进行分子对接验证.[结果]筛选出33种有效成分,其中一种有效成分没有相应的靶点,筛选出1 608个疾病靶点和115个药物与疾病的交集靶点.PPI分析得到的主要靶点为AKT1、TNF、IL-6、IL-1β、TP53、JUN、CASP3、MMP9、PTGS2等.GO生物功能富集分析获得生物过程条目22个、细胞成分条目57个、分子功能条目100个.KEGG通路富集分析筛选出20条信号通路,主要为脂质和动脉粥样硬化、MAPK、癌症信号通路等."Analyze Network"工具构建的有效成分-靶点-通路网络,筛选出钩藤治疗动脉粥样硬化的核心成分为槲皮素、山奈酚;核心靶点为PTGS2、HSP90AA1、PTGS1;核心通路为脂质和动脉粥样硬化、MAPK信号通路.