目的：挖掘隐藏在头颈部鳞癌中抑癌基因TP53表达异常的机制。方法从TCGA数据库中选取279例头颈部鳞癌样本的测序数据，利用cbioportal获得TP53基因在头颈部鳞癌中的表达情况及其对患者生存的影响，并筛选样本中与TP53存在共表达关系的基因。利用String和DAVID数据库，建立TP53的共表达网络并分析网络功能，通过lncRNA2target和StarBase数据库，筛选出能够调控TP53的短链非编码RNA（microRNA），长链非编码RNA（lncRNA）和竞争性内源性RNA（ceRNA），利用Cyto-scape软件建立TP53相关基因调控网络。结果279例头颈部鳞癌样本中共有77％的样本出现TP53表达异常，且TP53表达异常患者的生存率显著低于TP53正常表达的患者。此外，筛选出TP53基因的共表达基因288个，（Spearman分数和Pearson分数＞0．3）功能分析结果显示共表达基因的功能主要为转录调控、细胞凋亡、增殖过程和免疫应答等功能。TP53基因调控网络揭示has-miR-186-5p和has-miR-202-3p等43个microRNA能够靶向调控TP53基因；此外，MEG1、TUG1和MALAT1等6个lncRNA，PHC2、FZD4和TUB等56个mRNA能够通过ceRNA作用调控TP53。结论通过生物信息学方法和基因数据库建立的TP53相关基因调控网络揭示可能调控抑癌基因TP53的若干microRNA、lncRNA和ceRNA，可以为

作者：徐明义；郑艳秋；孙娟；胡文良；王亚平；崔晓波；李玲香

来源：局解手术学杂志 2016 年 25卷 12期