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目的 为了解云南省西南地区福寿螺的种群结构,对当地福寿螺的细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome c oxidase subunit Ⅰ,COⅠ)基因序列进行单核苷酸多态性分析. 方法 2016年11月18日至2017年5月8日,于云南省西双版纳州景洪市和勐腊县、普洱市思茅区和西盟县、临沧市耿马县及德宏州瑞丽市6个调查点采集福寿螺,进行形态学观察.提取福寿螺基因组DNA,PCR扩增CO Ⅰ基因,对将阳性PCR产物进行测序.采用MEGA 6.06软件进行序列特征分析、计算遗传距离.采用邻接法构建系统发育树. 结果 共采集福寿螺200只,无法通过形态学鉴定进行种类区分.PCR扩增获得129条CO Ⅰ基因序列(小管福寿螺Pomaceacanaliculata 123条,孤岛福寿螺P.insularum 6条),经多序列比对排齐后长度为621 bp,存在76个核苷酸变异位点,76个简约信息位点,无单一变异、插入和缺失位点、无碱基转换和颠换,A、G、T、C的平均含量分别为23.1%、20.5%、39.8%和16.7%;编码的207个氨基酸残基中,保守氨基酸有203个(占98.1%).CO Ⅰ基因序列分属4个单倍型(HAP) ——HAP-1、HAP-2、HAP-3和HAP-4.HAP-1频率最高,占71.3% (92/129),其次是HAP-3,占17.8% (23/129),HAP-2和HAP-4频率分别为6.2% (8/129)和4.7% (6/129).HAP-1、HAP-2和HAP-3与小管福寿螺的遗传距离最

作者:张苍林;保雪莹;彭佳;字金荣;冉甄;卢娜;杨亚明

来源:中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2019 年 37卷 1期

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作者:
张苍林;保雪莹;彭佳;字金荣;冉甄;卢娜;杨亚明
来源:
中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2019 年 37卷 1期
标签:
小管福寿螺 孤岛福寿螺 细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因 多态性 云南省
目的 为了解云南省西南地区福寿螺的种群结构,对当地福寿螺的细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome c oxidase subunit Ⅰ,COⅠ)基因序列进行单核苷酸多态性分析. 方法 2016年11月18日至2017年5月8日,于云南省西双版纳州景洪市和勐腊县、普洱市思茅区和西盟县、临沧市耿马县及德宏州瑞丽市6个调查点采集福寿螺,进行形态学观察.提取福寿螺基因组DNA,PCR扩增CO Ⅰ基因,对将阳性PCR产物进行测序.采用MEGA 6.06软件进行序列特征分析、计算遗传距离.采用邻接法构建系统发育树. 结果 共采集福寿螺200只,无法通过形态学鉴定进行种类区分.PCR扩增获得129条CO Ⅰ基因序列(小管福寿螺Pomaceacanaliculata 123条,孤岛福寿螺P.insularum 6条),经多序列比对排齐后长度为621 bp,存在76个核苷酸变异位点,76个简约信息位点,无单一变异、插入和缺失位点、无碱基转换和颠换,A、G、T、C的平均含量分别为23.1%、20.5%、39.8%和16.7%;编码的207个氨基酸残基中,保守氨基酸有203个(占98.1%).CO Ⅰ基因序列分属4个单倍型(HAP) ——HAP-1、HAP-2、HAP-3和HAP-4.HAP-1频率最高,占71.3% (92/129),其次是HAP-3,占17.8% (23/129),HAP-2和HAP-4频率分别为6.2% (8/129)和4.7% (6/129).HAP-1、HAP-2和HAP-3与小管福寿螺的遗传距离最