目的 通过应用全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)技术分析某三级医疗机构耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii,CRAB)的耐药基因、毒力因子及同源性.方法 收集该院2020年1月至3月重症监护病房(Intensive care unit,ICU)、神经外科分离的11株医院感染CRAB菌株,通过二代测序平台进行全基因组测序,应用基因组流行病学中心(Center for genomic epidemiology,CGE)ResFinder 4.0软件分析其耐药基因型,并应用MORPHEUS在线制作热图,应用毒力因子数据库(virulence factors of pathogenic bacteria,VFDB)VFanalyzer软件筛选毒力因子,应用MLST软件检测菌株的ST型,应用Kaptive软件检测荚膜型,应用CSI Phylogeny 1.4软件及FigTree v1.4.4软件构建最大似然树(maximum likelihood tree,MLT)以分析其同源性.结果 11株CRAB对亚胺培南、美罗培南、头孢菌素、环丙沙星均呈现耐药,而对阿米卡星、左氧氟沙星耐药的菌株株数较少.11株CRAB共检测出18种耐药基因,11株同时携带碳青霉烯酶耐药基因blaOXA-23和blaOXA-66,β-内酰胺酶耐药基因以blaTEM-1D和blaADC-25为主,大部分菌株携带多种外排泵相关耐药基因及抗菌药物修饰酶耐药基因.11株CRAB均携带多种毒力因子,包括外膜孔蛋白
作者:胡小骞;王琴
来源:中国抗生素杂志 2022 年 47卷 9期