您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览180 | 下载52

目的 应用生信分析方法筛选高危神经母细胞瘤的差异表达基因(DEG).方法 从GEO数据库下载2个高危神经母细胞瘤数据集(GSE49710、GSE73517),筛选DEG,应用GO和KEGG进行富集分析,构建PPI网络筛选中枢基因.结果 GSE49710包括34个上调DEG和284个下调DEG,GSE73517包括62个上调DEG和309个下调DEG.GO分析显示,生物过程主要集中在细胞粘附、GTP酶活性的正调节、转录的负调节、DNA模板化、凋亡过程的负调节、中枢神经系统发育,调节的细胞成分富集在膜的组成部分、细胞外区域、质膜的组成部分、细胞外空间,调节的分子功能富集于钙离子结合、受体结合.KEGG分析显示在可卡因成瘾、造血细胞谱系、NOD样受体信号通路、糖胺聚糖生物合成-硫酸乙酰肝素/肝素中显著富集.PPI网络确定5个中枢基因(ADRB2、MC4R、CD69、RBFOX1和IL7R).结论 ADRB2、MC4R、CD69、RBFOX1和IL7R可能与高危神经母细胞瘤的发生、发展相关,也可为高危神经母细胞瘤提供潜在治疗靶点.

作者:郭文才;李锐;李龙祥;吴勇

来源:中国临床神经外科杂志 2021 年 26卷 8期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:180 | 下载:52
作者:
郭文才;李锐;李龙祥;吴勇
来源:
中国临床神经外科杂志 2021 年 26卷 8期
标签:
神经母细胞瘤;生物信息学;生物标志物;差异表达基因
目的 应用生信分析方法筛选高危神经母细胞瘤的差异表达基因(DEG).方法 从GEO数据库下载2个高危神经母细胞瘤数据集(GSE49710、GSE73517),筛选DEG,应用GO和KEGG进行富集分析,构建PPI网络筛选中枢基因.结果 GSE49710包括34个上调DEG和284个下调DEG,GSE73517包括62个上调DEG和309个下调DEG.GO分析显示,生物过程主要集中在细胞粘附、GTP酶活性的正调节、转录的负调节、DNA模板化、凋亡过程的负调节、中枢神经系统发育,调节的细胞成分富集在膜的组成部分、细胞外区域、质膜的组成部分、细胞外空间,调节的分子功能富集于钙离子结合、受体结合.KEGG分析显示在可卡因成瘾、造血细胞谱系、NOD样受体信号通路、糖胺聚糖生物合成-硫酸乙酰肝素/肝素中显著富集.PPI网络确定5个中枢基因(ADRB2、MC4R、CD69、RBFOX1和IL7R).结论 ADRB2、MC4R、CD69、RBFOX1和IL7R可能与高危神经母细胞瘤的发生、发展相关,也可为高危神经母细胞瘤提供潜在治疗靶点.