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目的 用网络药理学与分子对接的方法探析菟丝子治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在分子作用机制.方法 通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及相关文献,筛选及预测出菟丝子的活性成分及潜在作用靶标.同时,从基因疾病关联数据库(DisGeNET)、人类孟德尔遗传综合数据库(OMIM)、药物靶标数据库(DrugBank)、比较毒物基因组数据库(CTD)、遗传药理学与药物基因组学数据库(PharmGKB)疾病数据库收集糖尿病的相关靶标,取两者的交集得到药物-疾病蛋白靶基因,筛选出共同的T2DM靶标,然后导入到STRING数据库进行PPI网络构建,通过Cytoscape软件将结果进行网络化展示,通过网络拓扑算法筛选出关键作用靶标,再用SystemsDock Web Site对其进行分子对接验证;用基因本体富集分析软件工具包(GOEAST)与注释、可视化和集成发现数据库(DAVID)在线工具对关键靶基因进行基因本体(GO)分析;通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析并结合相关文献,分析菟丝子治疗T2DM的作用机制.结果 从口服生物利用度(OB)与类药性(DL)数值筛选出菟丝子10个候选活性成分和193个预测靶标;通过疾病数据库检索到与T2DM发生发展相关的已知疾病靶标1671个;菟丝子主要作用于T2DM的前列腺癌通路、雌激素信号通路、癌症途径和癌症中的蛋白多糖、膀胱

作者:于莹;张功;韩涛;黄海量

来源:中国临床药理学杂志 2020 年 36卷 7期

知识库介绍

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作者:
于莹;张功;韩涛;黄海量
来源:
中国临床药理学杂志 2020 年 36卷 7期
标签:
网络药理学 分子对接 菟丝子 2型糖尿病 通路分析
目的 用网络药理学与分子对接的方法探析菟丝子治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在分子作用机制.方法 通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及相关文献,筛选及预测出菟丝子的活性成分及潜在作用靶标.同时,从基因疾病关联数据库(DisGeNET)、人类孟德尔遗传综合数据库(OMIM)、药物靶标数据库(DrugBank)、比较毒物基因组数据库(CTD)、遗传药理学与药物基因组学数据库(PharmGKB)疾病数据库收集糖尿病的相关靶标,取两者的交集得到药物-疾病蛋白靶基因,筛选出共同的T2DM靶标,然后导入到STRING数据库进行PPI网络构建,通过Cytoscape软件将结果进行网络化展示,通过网络拓扑算法筛选出关键作用靶标,再用SystemsDock Web Site对其进行分子对接验证;用基因本体富集分析软件工具包(GOEAST)与注释、可视化和集成发现数据库(DAVID)在线工具对关键靶基因进行基因本体(GO)分析;通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析并结合相关文献,分析菟丝子治疗T2DM的作用机制.结果 从口服生物利用度(OB)与类药性(DL)数值筛选出菟丝子10个候选活性成分和193个预测靶标;通过疾病数据库检索到与T2DM发生发展相关的已知疾病靶标1671个;菟丝子主要作用于T2DM的前列腺癌通路、雌激素信号通路、癌症途径和癌症中的蛋白多糖、膀胱