目的:用基因表达谱芯片检测非肥胖性糖尿病(non‐obese diabetic ,NOD)小鼠在1型糖尿病(T1DM )发病过程中的基因表达。方法:分离 T1DM 未发病及发病 NOD小鼠的胰岛细胞,提取其总RNA后,与瑞士 Roche NimbleGen公司的12×135K基因表达谱芯片杂交。采用NimbleScan软件分析表达数据。结果:未发病NOD小鼠组和发病NOD小鼠组共有1007个差异表达基因。基因本体(gene ontology ,GO )分析显示,在生物学过程方面,上调基因中87.7%与代谢相关,下调基因中18.97%与代谢相关;在细胞组分方面,29.20%的上调基因与细胞及细胞成分相关,78.08%的下调基因与细胞骨架、微管细胞骨架相关;在分子功能方面,84.07%的上调基因与结合有关,30.77%下调基因与水解酶活性相关。Pathw ay分析显示,上调的信号通路主要为黏蛋白型O聚糖合成信号通路,下调的信号通路主要为血管加压素信号通路。结论:T1DM 发病NOD小鼠和未发病NOD小鼠的胰岛细胞的基因表达水平有明显差异。
作者:李敏;宋陆军;高晓东;常文举;付亮;秦新裕
来源:中国临床医学 2015 年 1期