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目的 运用网络药理学及分子对接技术,探究苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病(AD)的活性成分和潜在作用机制.方法 通过文献搜集苗药黑骨藤的化学成分,利用中药系统药理学数据库(TCMSP)和Swiss ADME数据库筛选黑骨藤的主要活性成分,采用Swiss Target Prediction和SEA数据库预测活性成分的作用靶点.通过GeneCards、OMIM数据库检索AD相关靶点,经Venny2.1.0获取成分-疾病交集靶点,结合STRING数据库和Cytoscape3.8.0 软件对交集靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析.再借助HIPLOT数据库对交集靶点进行基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.最后,利用AutoDock Tools1.5.6软件将潜在成分与核心靶点进行分子对接.结果 苗药黑骨藤的活性成分共 24 个,对应靶点 574 个,1 513个AD靶点,交集靶点159个;GO分析得到2 661条生物过程,587 条分子功能,311 条细胞成分;KEGG分析得到AD主要参与神经退行性疾病-多发性疾病途径、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、癌症中的蛋白多糖等相关通路.分子对接结果显示,山柰酚、槲皮素、汉黄芩素、丹参酮ⅡA、杠柳苷元等与类固醇受体辅助活化因子(SRC)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)3、血管内皮生长因子(VEGF)A蛋白等具有较强结合能力.结论 通过成分-靶点-通路网络及分子对接验证,筛选出

作者:舒燕霞;郭江涛;徐文芬;张永萍;孙开芬;石兴雨;曾令琴

来源:中国老年学杂志 2023 年 43卷 22期

知识库介绍

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舒燕霞;郭江涛;徐文芬;张永萍;孙开芬;石兴雨;曾令琴
来源:
中国老年学杂志 2023 年 43卷 22期
标签:
黑骨藤 网络药理学 分子对接 阿尔茨海默病 Periploca forrestii Network pharmacology Molecular docking Alzheimer's disease
目的 运用网络药理学及分子对接技术,探究苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病(AD)的活性成分和潜在作用机制.方法 通过文献搜集苗药黑骨藤的化学成分,利用中药系统药理学数据库(TCMSP)和Swiss ADME数据库筛选黑骨藤的主要活性成分,采用Swiss Target Prediction和SEA数据库预测活性成分的作用靶点.通过GeneCards、OMIM数据库检索AD相关靶点,经Venny2.1.0获取成分-疾病交集靶点,结合STRING数据库和Cytoscape3.8.0 软件对交集靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析.再借助HIPLOT数据库对交集靶点进行基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.最后,利用AutoDock Tools1.5.6软件将潜在成分与核心靶点进行分子对接.结果 苗药黑骨藤的活性成分共 24 个,对应靶点 574 个,1 513个AD靶点,交集靶点159个;GO分析得到2 661条生物过程,587 条分子功能,311 条细胞成分;KEGG分析得到AD主要参与神经退行性疾病-多发性疾病途径、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、癌症中的蛋白多糖等相关通路.分子对接结果显示,山柰酚、槲皮素、汉黄芩素、丹参酮ⅡA、杠柳苷元等与类固醇受体辅助活化因子(SRC)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)3、血管内皮生长因子(VEGF)A蛋白等具有较强结合能力.结论 通过成分-靶点-通路网络及分子对接验证,筛选出