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目的 对2007~2009年度南宁市流行性感冒病毒NA序列分析,阐明NA基因变异和进化特征.方法 提取2007 ~ 2009年30株(每年10株)H3N2亚型病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒NA基因后进行序列测定,利用VectorNTI 9.0对测序结果分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对,用Mage 4.1构建系统进化树.结果 南宁市2007 ~ 2009年H3N2亚型流感病毒被分为3个分枝,其中疫苗株A/Wisconsin/67/2005独立形成一个分支(类群Ⅰ),A/Brisbane/59/2007与2007年毒株(除339外)形成类群Ⅱ,2008和2009年毒株聚集成类群Ⅲ.NA基因在质尾区域、极性跨膜区、柄部区域有个别毒株个别位点发生了替换.抗原区域328~ 336替换频率较高,2008年毒株抗原位点更活跃.A/nanning/242/2007在酶活性位点发生了D151E替换,可能导致NA对扎纳米韦和奥斯他韦的轻微耐药性;A/nanning/242/2007、A/nanning/561/2008分别在非活性位点N234D,在G286D的替换则可能影响NA介导的病毒粒子的释放从而影响NA蛋白的活性.结论 南宁市2007~2009年毒株NA均发生了较大变异,当年疫苗株均滞后南宁流行株.

作者:范云燕;刘海燕;林新勤;秦剑秋;黄莉;覃巍巍

来源:中国热带医学 2012 年 12卷 9期

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作者:
范云燕;刘海燕;林新勤;秦剑秋;黄莉;覃巍巍
来源:
中国热带医学 2012 年 12卷 9期
标签:
流感病毒 H3N2 神经氨酸酶 基因分析
目的 对2007~2009年度南宁市流行性感冒病毒NA序列分析,阐明NA基因变异和进化特征.方法 提取2007 ~ 2009年30株(每年10株)H3N2亚型病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒NA基因后进行序列测定,利用VectorNTI 9.0对测序结果分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对,用Mage 4.1构建系统进化树.结果 南宁市2007 ~ 2009年H3N2亚型流感病毒被分为3个分枝,其中疫苗株A/Wisconsin/67/2005独立形成一个分支(类群Ⅰ),A/Brisbane/59/2007与2007年毒株(除339外)形成类群Ⅱ,2008和2009年毒株聚集成类群Ⅲ.NA基因在质尾区域、极性跨膜区、柄部区域有个别毒株个别位点发生了替换.抗原区域328~ 336替换频率较高,2008年毒株抗原位点更活跃.A/nanning/242/2007在酶活性位点发生了D151E替换,可能导致NA对扎纳米韦和奥斯他韦的轻微耐药性;A/nanning/242/2007、A/nanning/561/2008分别在非活性位点N234D,在G286D的替换则可能影响NA介导的病毒粒子的释放从而影响NA蛋白的活性.结论 南宁市2007~2009年毒株NA均发生了较大变异,当年疫苗株均滞后南宁流行株.