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目的 与方法从GenBank中下载了19株O型口蹄疫病毒的Lab、3C、3D基因,结合本实验室收录的FMDV OA/58 Lab、3C、3D的序列信息,分析比较了三种FMDV蛋白酶(Lpro, 3Cpro, 3Dpol)的编码序列和氨基酸序列.结果 这FMDV具有的蛋白酶的编码序列在突变上没有显著差异(P>0.05),而在氨基酸序列的突变上存在着显著差异(P<0.01).通过多重比较发现Lpro与3Cpro和3Dpol在氨基酸突变上存在差异(P<0.05),而3Cpro和3Dpol之间突变差异不显著.结论 利用Swiss-pdbViewer蛋白质分析软件模拟三种蛋白酶中各个突变热点氨基酸残基的替换,发现突变热点不影响三种蛋白酶的空间结构.这表明病毒基因组在复制过程中的突变只是FMDV变异的原始动力,而FMDV变异的方向性进化动力是感染FMDV的宿主细胞对病毒蛋白酶功能造成的选择压力.

作者:周建华;丛国正;常惠芸

来源:中国人兽共患病学报 2009 年 25卷 7期

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作者:
周建华;丛国正;常惠芸
来源:
中国人兽共患病学报 2009 年 25卷 7期
标签:
口蹄疫病毒 病毒蛋白酶 突变 Foot-and-mouth disease virus viral protease mutation
目的 与方法从GenBank中下载了19株O型口蹄疫病毒的Lab、3C、3D基因,结合本实验室收录的FMDV OA/58 Lab、3C、3D的序列信息,分析比较了三种FMDV蛋白酶(Lpro, 3Cpro, 3Dpol)的编码序列和氨基酸序列.结果 这FMDV具有的蛋白酶的编码序列在突变上没有显著差异(P>0.05),而在氨基酸序列的突变上存在着显著差异(P<0.01).通过多重比较发现Lpro与3Cpro和3Dpol在氨基酸突变上存在差异(P<0.05),而3Cpro和3Dpol之间突变差异不显著.结论 利用Swiss-pdbViewer蛋白质分析软件模拟三种蛋白酶中各个突变热点氨基酸残基的替换,发现突变热点不影响三种蛋白酶的空间结构.这表明病毒基因组在复制过程中的突变只是FMDV变异的原始动力,而FMDV变异的方向性进化动力是感染FMDV的宿主细胞对病毒蛋白酶功能造成的选择压力.