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目的 本研究从流感样病例样本中分离出湖南省首例人感染H3N8亚型AIV毒株,并对该毒株进行了分子进化分析,为人感染H3N8亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)的防控提供实验室依据.方法 通过实时荧光RT-PCR方法检测甲型流感病毒核酸、接种MDCK细胞进行病毒培养并通过血凝试验进行初步鉴定,继而对分离到的AIV进行高通量二代基因测序,并将测序结果进行相似性比较、基因特征和进化分析.结果 鉴定出人感染H3N8亚型AIV分离株(A/Changsha/1000/2022(H3N8),相似性分析显示HA和NA基因序列与来自河南省的人感染AIV株A/Henan/4-10CNIC/2022(H3N8)相似性最高,6个内部基因(MP、NS、PB1、PB2、NP、PA)均来源于 H9N2亚型AIV.HA蛋白裂解位点为PE-KQTR/GLF,未出现连续重复碱性氨基酸,符合低致病性AIV的特征,NA基因出现了耐药位点I312V突变,可能对奥司他韦有耐药性改变.PB2基因出现E627V宿主适应性突变,M2蛋白出现S31N金刚烷胺耐药性位点突变.分子进化显示HA基因属于欧亚分支,NA基因属于北美分支,NS、PB2、MP和PB1基因与湖南省内来源的H9N2毒株亲缘关系密切.结论 此次新发现的人源A/Changsha/1000/2022(H3N8)毒株所有基因片段均来源于禽类,属于新型重组低致病性AIV,有可能突破物种屏障发生禽到人之间的传播,建议完善流

作者:裴瑞青;张如胜;叶文;欧新华;姚栋;李灵之;肖姗;黄政

来源:中国人兽共患病学报 2023 年 39卷 4期

知识库介绍

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作者:
裴瑞青;张如胜;叶文;欧新华;姚栋;李灵之;肖姗;黄政
来源:
中国人兽共患病学报 2023 年 39卷 4期
标签:
禽流感 H3N8亚型 分子进化 突变
目的 本研究从流感样病例样本中分离出湖南省首例人感染H3N8亚型AIV毒株,并对该毒株进行了分子进化分析,为人感染H3N8亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)的防控提供实验室依据.方法 通过实时荧光RT-PCR方法检测甲型流感病毒核酸、接种MDCK细胞进行病毒培养并通过血凝试验进行初步鉴定,继而对分离到的AIV进行高通量二代基因测序,并将测序结果进行相似性比较、基因特征和进化分析.结果 鉴定出人感染H3N8亚型AIV分离株(A/Changsha/1000/2022(H3N8),相似性分析显示HA和NA基因序列与来自河南省的人感染AIV株A/Henan/4-10CNIC/2022(H3N8)相似性最高,6个内部基因(MP、NS、PB1、PB2、NP、PA)均来源于 H9N2亚型AIV.HA蛋白裂解位点为PE-KQTR/GLF,未出现连续重复碱性氨基酸,符合低致病性AIV的特征,NA基因出现了耐药位点I312V突变,可能对奥司他韦有耐药性改变.PB2基因出现E627V宿主适应性突变,M2蛋白出现S31N金刚烷胺耐药性位点突变.分子进化显示HA基因属于欧亚分支,NA基因属于北美分支,NS、PB2、MP和PB1基因与湖南省内来源的H9N2毒株亲缘关系密切.结论 此次新发现的人源A/Changsha/1000/2022(H3N8)毒株所有基因片段均来源于禽类,属于新型重组低致病性AIV,有可能突破物种屏障发生禽到人之间的传播,建议完善流