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目的 检测雌雄小鼠肝组织蛋白质组表达差异,探讨肝病发生的性别差异机制.方法 采用双向荧光差异凝胶电泳(two dimension difference gel electrophoresis,2D-DIGE)和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术检测C57BL/6J雌雄小鼠肝组织的蛋白质组差异表达谱,分离并鉴定差异表达蛋白,应用Western blot进行验证,并对差异表达蛋白进行生物信息学分析,包括蛋白功能注释、分类分析、京都基因与基因组百科全书通路分析.结果 经双向荧光差异凝胶电泳-图像分析得到1767个蛋白点,其中差异倍数≥1.5(P<0.05)的蛋白点325个.从中选择78个差异蛋白点进行MALDI-TOF-MS鉴定,得到48种差异性表达的蛋白质.其中,与雌鼠相比,雄鼠肝组织中高表达的蛋白有14种,低表达的蛋白有34种.选取6个差异蛋白点进行Western blot验证,证明了2D-DIGE结果的可靠性.GO分析结果显示,涉及雌雄鼠肝组织中的差异蛋白在细胞组分、分子功能、生物学过程中的分布广泛.KEGG通路分析发现差异蛋白涉及6条信号通路.结论 C57BL/6J雌雄小鼠肝组织的差异性蛋白表达的检测结果为研究性别差异性肝病发生的分子机制提供了基础生物学信息和有益的线索.

作者:戎卓娜;李慧玲;董鹏辉;樊婷婷;李娟;赵毅;王福金;王爱国;王靖宇

来源:中国比较医学杂志 2017 年 27卷 10期

知识库介绍

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作者:
戎卓娜;李慧玲;董鹏辉;樊婷婷;李娟;赵毅;王福金;王爱国;王靖宇
来源:
中国比较医学杂志 2017 年 27卷 10期
标签:
肝 性别差异 蛋白质组学 生物信息学 双向荧光差异凝胶电泳 Liver Gender difference Proteomic Bioinformatics Two dimension difference gel electrophoresis 2D-DIGE
目的 检测雌雄小鼠肝组织蛋白质组表达差异,探讨肝病发生的性别差异机制.方法 采用双向荧光差异凝胶电泳(two dimension difference gel electrophoresis,2D-DIGE)和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术检测C57BL/6J雌雄小鼠肝组织的蛋白质组差异表达谱,分离并鉴定差异表达蛋白,应用Western blot进行验证,并对差异表达蛋白进行生物信息学分析,包括蛋白功能注释、分类分析、京都基因与基因组百科全书通路分析.结果 经双向荧光差异凝胶电泳-图像分析得到1767个蛋白点,其中差异倍数≥1.5(P<0.05)的蛋白点325个.从中选择78个差异蛋白点进行MALDI-TOF-MS鉴定,得到48种差异性表达的蛋白质.其中,与雌鼠相比,雄鼠肝组织中高表达的蛋白有14种,低表达的蛋白有34种.选取6个差异蛋白点进行Western blot验证,证明了2D-DIGE结果的可靠性.GO分析结果显示,涉及雌雄鼠肝组织中的差异蛋白在细胞组分、分子功能、生物学过程中的分布广泛.KEGG通路分析发现差异蛋白涉及6条信号通路.结论 C57BL/6J雌雄小鼠肝组织的差异性蛋白表达的检测结果为研究性别差异性肝病发生的分子机制提供了基础生物学信息和有益的线索.