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目的:探讨HLA-A,-B,-DRB1高分辨等位基因及单体型多态性与北方汉族急性髓系白血病(AML)和慢性髓系白血病(CML)的相关性.方法:以1241例健康非亲缘造血干细胞捐献者为对照,采用PCR-SBT、-SSO和-SSP方法对259例髓系白血病患者进行HLA-A,B,DRB1高分辨分型,运用Arleguin 3.5.2软件计算基因频率及单体型频率,病例对照研究计算疾病比值比(ocld ratio,OR);用Swiss-Model对差异HLA分子进行同源建模,Swiss-Pd-bViewerv4.1软件对分子间三维结构进行差异比对.结果:经x2检验、连续校正显示,AML组(n=189)的A*02∶07 (8.47% vs 5.28%,P=0.013)、A*29∶01 (1.85% vs0.68%,P=0.044)、B*07∶02 (5.29% vs 3.10%,P=0.029)、B*07:05∶01G(1.85% vs0.68%,P=0.044)、B*35∶02(1.06% vs0.20%,P=0.023)的基因频率高于对照组,而AML组的A*02∶03频率则低于对照组(0.79% vs 3.10%,P=0.011).CML组(n=70)的B*46∶01频率低于对照组(2.86% vs 7.82%,P=0.031),但上述等位基因经Bonferroni校正后,均显示无统计学差异.经Fisher精确概率检验和Bonferroni校正,DRB1* 11∶28及其单体型A*24:02-B* 15∶01-DRB1* 11∶28频率在陕西籍CML患者中显著升高(1.43% vs 0.00%,Pc'=0.015;1.43% vs0.00%,P=0.003).Swiss-PdbViewer v 4.1

作者:齐珺;王天菊;陈利萍;王满妮;武君华;杜丹

来源:中国实验血液学杂志 2018 年 26卷 1期

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作者:
齐珺;王天菊;陈利萍;王满妮;武君华;杜丹
来源:
中国实验血液学杂志 2018 年 26卷 1期
标签:
髓系白血病 人类白细胞抗原 北方汉族 单体型 基因频率 比值比 HLA分子三维结构模拟 myeloid leukemia HLA north China Han population haplotype gene frequency odd ratio HLA three-dimensional structure model
目的:探讨HLA-A,-B,-DRB1高分辨等位基因及单体型多态性与北方汉族急性髓系白血病(AML)和慢性髓系白血病(CML)的相关性.方法:以1241例健康非亲缘造血干细胞捐献者为对照,采用PCR-SBT、-SSO和-SSP方法对259例髓系白血病患者进行HLA-A,B,DRB1高分辨分型,运用Arleguin 3.5.2软件计算基因频率及单体型频率,病例对照研究计算疾病比值比(ocld ratio,OR);用Swiss-Model对差异HLA分子进行同源建模,Swiss-Pd-bViewerv4.1软件对分子间三维结构进行差异比对.结果:经x2检验、连续校正显示,AML组(n=189)的A*02∶07 (8.47% vs 5.28%,P=0.013)、A*29∶01 (1.85% vs0.68%,P=0.044)、B*07∶02 (5.29% vs 3.10%,P=0.029)、B*07:05∶01G(1.85% vs0.68%,P=0.044)、B*35∶02(1.06% vs0.20%,P=0.023)的基因频率高于对照组,而AML组的A*02∶03频率则低于对照组(0.79% vs 3.10%,P=0.011).CML组(n=70)的B*46∶01频率低于对照组(2.86% vs 7.82%,P=0.031),但上述等位基因经Bonferroni校正后,均显示无统计学差异.经Fisher精确概率检验和Bonferroni校正,DRB1* 11∶28及其单体型A*24:02-B* 15∶01-DRB1* 11∶28频率在陕西籍CML患者中显著升高(1.43% vs 0.00%,Pc'=0.015;1.43% vs0.00%,P=0.003).Swiss-PdbViewer v 4.1