目的:通过生物信息学方法筛选急性髓系白血病(AML)患者骨髓间充质干细胞(BM-MSC)衰老相关的差异表达基因并予以验证,为AML的科研和临床提供新的分子标志物.方法:应用血液病医院AML患者BM-MSC制作基因表达谱芯片并参考从NCBI数据库GEO中选取的芯片GSE84881,综合地进行数据分析并筛选差异表达基因.运用DAVID分析软件进行基因本体论(G0)富集分析和KEGG通路富集分析,筛选出与AML患者BM-MSC衰老相关的差异表达基因.收集病人及健康供者的骨髓样本,体外扩增MSC并应用RT-PCR技术检测衰老相关基因表达水平与芯片的一致性,辅以衰老相关β-半乳糖苷酶染色实验和MTT细胞增殖实验对AML患者BM-MSC表型和功能进行验证.结果:筛选出247个差异表达基因,其中有132个基因表达上调,115个基因表达下调.侧重分析6个衰老相关基因,包括表达上调基因COL3A1(P=0.025)、CRYAB(P=0.0003)、DCN(P=0.0368)以及表达下调基因CCL2(P=0.0256)、CTSC(P=0.0001)、IL6(P=0.0482).RT-PCR实验结果提示,上述基因的表达差异与AML患者BM-MSC的衰老具有相关性.衰老相关β-半乳糖苷酶染色实验证实,AML患者BM-MSC的染色阳性率与健康供者相比显著增高(P＜ 0.0001);MTT实验表明,与健康供者相比,AML患者BM-MSC的增殖能力降低(P＜0.0001).结论:运用生物信息

作者：刘诗琦；程晶莹；姜雅静；李英；李庆华；庞天翔

来源：中国实验血液学杂志 2019 年 27卷 2期