目的：探讨高通量测序技术在慢性咽炎患者耐药基因分布中的应用。方法选取2010年5月至2012年5月本院门诊收治的慢性咽炎患者360例，采集患者咽后壁分泌物，提取质粒 DNA 并进行 Solexa 高通量测序，通过比对在 NCBI 质粒基因组数据库进行物种鉴定，通过与 ARDB 数据库进行比对进行耐药基因鉴定。结果本研究共鉴定出307个质粒，分属25种病原菌，所占比例最高的为α-溶血性链球菌（12．87％），其次为副流感嗜血菌（9．86％）。通过与 ARDB 中已知的380种 ARG 比对，共有4015条序列与已知耐药基因序列一致。其中氨基糖苷类耐药基因、β内酰胺酶类耐药基因、大环内酯类耐药基因及四环素类耐药基因占较高的比例。同时我们也检测到一个多重耐药基因 lsa。结论高通量测序技术可以高效、准确地检测慢性咽炎患者中咽部细菌的耐药基因，为临床慢性咽炎治疗方案的选择提供理论基础。
作者：汪常伟；魏妍慧；李彦华
来源：中国实验诊断学 2014 年 5期
