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目的:检测并分析肛瘘患者的特征性微小RNA(miRNA)表达谱,探讨其可能的靶基因和临床意义。方法收集2014年3—12月间杭州市第三人民医院肛肠外科收治的3例肛瘘联合混合痔切除手术患者的痔核近端肛管黏膜标本(肛瘘组),另选取年龄、性别和体质量与之相匹配的行单纯混合痔手术的3例患者的肛管黏膜标本作为对照(对照组)。利用miRNA微阵列芯片检测比较两组肛管黏膜的1285个miRNAs的表达差异,并通过聚类分析差异miRNAs的聚集性(差异基因的筛选标准是:P ≤0.05且变化倍数≥2或≤0.5);采用DIANAmT、miRanda、 miRDB、 miRWalk等10种预测软件对差异miRNAs的靶基因进行预测,并进行综合打分,确定出预测分值最高的基因;采用基因本体(GO)富集法分析与靶基因相关的生物学过程;利用免疫组织化学方法检测两组肛管黏膜中分值最高基因的蛋白表达。结果肛瘘组患者的1285个miRNA中,发现13个miRNA与对照组存在显著差异,其中在肛瘘组上调2个,下调11个。经配对t检验显示,肛瘘组中miR-3609上调是对照组的5.98倍(P=0.0231),miR-181a-2-3p下调0.13倍(P=0.0067),是差异表达最大的miRNA。进一步聚类分析显示,上调的hsa-miR-3609和hsa-miR-6086相对表达量在两组间的变化趋势一致;下调的11个miRN

作者:裘建明;余吉平;杨关根;徐侃;陶勇;林阿丽;王东

来源:中华胃肠外科杂志 2016 年 19卷 7期

知识库介绍

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作者:
裘建明;余吉平;杨关根;徐侃;陶勇;林阿丽;王东
来源:
中华胃肠外科杂志 2016 年 19卷 7期
标签:
肛瘘 微小RNA 靶基因 Anal fistula MicroRNA Target genes
目的:检测并分析肛瘘患者的特征性微小RNA(miRNA)表达谱,探讨其可能的靶基因和临床意义。方法收集2014年3—12月间杭州市第三人民医院肛肠外科收治的3例肛瘘联合混合痔切除手术患者的痔核近端肛管黏膜标本(肛瘘组),另选取年龄、性别和体质量与之相匹配的行单纯混合痔手术的3例患者的肛管黏膜标本作为对照(对照组)。利用miRNA微阵列芯片检测比较两组肛管黏膜的1285个miRNAs的表达差异,并通过聚类分析差异miRNAs的聚集性(差异基因的筛选标准是:P ≤0.05且变化倍数≥2或≤0.5);采用DIANAmT、miRanda、 miRDB、 miRWalk等10种预测软件对差异miRNAs的靶基因进行预测,并进行综合打分,确定出预测分值最高的基因;采用基因本体(GO)富集法分析与靶基因相关的生物学过程;利用免疫组织化学方法检测两组肛管黏膜中分值最高基因的蛋白表达。结果肛瘘组患者的1285个miRNA中,发现13个miRNA与对照组存在显著差异,其中在肛瘘组上调2个,下调11个。经配对t检验显示,肛瘘组中miR-3609上调是对照组的5.98倍(P=0.0231),miR-181a-2-3p下调0.13倍(P=0.0067),是差异表达最大的miRNA。进一步聚类分析显示,上调的hsa-miR-3609和hsa-miR-6086相对表达量在两组间的变化趋势一致;下调的11个miRN