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目的:探讨骨碎补治疗骨质疏松(OP)的作用机制.方法:采用中药系统药理学成分分析平台(BATMAN-TCM)数据库获得骨碎补的活性化合物及其作用靶点,再通过GeneCards数据库获得相关化合物靶点,取两者交集得到骨碎补作用靶点.通过TTD、DrugBank、OMIM、GAD、PharmGKB、CTD数据库获得OP疾病相关靶点,与骨碎补作用靶点取交集后获得骨碎补-OP疾病交集靶点.运用STRING在线数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,再通过Cytoscape 3.6.1软件进行分析获得关键靶点,并进行可视化展示.借助DAVID在线工具进行交集靶点的基因本体论(GO)分析.通过在线分析工具KOBAS进行KEGG通路富集分析,筛选出显著富集的通路(P<0.05).通过MCC算法进行关键基因的筛选.结果:共获得骨碎补活性化合物7个,骨碎补-OP疾病交集靶点136个.GO分析结果显示,上述交集靶点的生物途径主要包括化学反应、类固醇代谢过程、细胞对化学刺激的应答等;细胞组分主要包括细胞外间隙、胞外区部分、细胞质等;分子功能主要有血红素结合、四吡咯结合、单氧酶活性等.KEGG通路富集结果显示,上述靶点主要与骨代谢、内分泌、炎症、肿瘤、细胞凋亡等信号通路相关.通过MCC算法筛选得到关键基因30个,包括ALB、AKT1、JUN等(P≤1.96×10-9).结论:骨碎补治疗OP的作用机制呈多靶点、多系

作者:林适;吴潇烁;陈柏行;陈超;吴宇航;周琦石;何才勇

来源:中国药房 2019 年 30卷 10期

知识库介绍

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林适;吴潇烁;陈柏行;陈超;吴宇航;周琦石;何才勇
来源:
中国药房 2019 年 30卷 10期
标签:
骨碎补 骨质疏松症 作用机制 通路 靶点 网络药理学
目的:探讨骨碎补治疗骨质疏松(OP)的作用机制.方法:采用中药系统药理学成分分析平台(BATMAN-TCM)数据库获得骨碎补的活性化合物及其作用靶点,再通过GeneCards数据库获得相关化合物靶点,取两者交集得到骨碎补作用靶点.通过TTD、DrugBank、OMIM、GAD、PharmGKB、CTD数据库获得OP疾病相关靶点,与骨碎补作用靶点取交集后获得骨碎补-OP疾病交集靶点.运用STRING在线数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,再通过Cytoscape 3.6.1软件进行分析获得关键靶点,并进行可视化展示.借助DAVID在线工具进行交集靶点的基因本体论(GO)分析.通过在线分析工具KOBAS进行KEGG通路富集分析,筛选出显著富集的通路(P<0.05).通过MCC算法进行关键基因的筛选.结果:共获得骨碎补活性化合物7个,骨碎补-OP疾病交集靶点136个.GO分析结果显示,上述交集靶点的生物途径主要包括化学反应、类固醇代谢过程、细胞对化学刺激的应答等;细胞组分主要包括细胞外间隙、胞外区部分、细胞质等;分子功能主要有血红素结合、四吡咯结合、单氧酶活性等.KEGG通路富集结果显示,上述靶点主要与骨代谢、内分泌、炎症、肿瘤、细胞凋亡等信号通路相关.通过MCC算法筛选得到关键基因30个,包括ALB、AKT1、JUN等(P≤1.96×10-9).结论:骨碎补治疗OP的作用机制呈多靶点、多系