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目的 筛选糖皮质激素性骨质疏松(GIOP)破骨细胞中差异表达的环状RNA(circRNA),并分析地塞米松对其作用.方法 通过密度差异离心法分离收集9例患者血液中的单核细胞,设置对照组、地塞米松刺激组(1×10-7M地塞米松+50 ng/ml核因子κ-B配体受体致活剂(RANKL)+25 ng/ml人乳腺癌细胞(MCF)-1)和诱导组(50 ng/ml RANKL+25 ng/ml巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF)3个分组,分别诱导分化培养7、14、21 d,观察单核细胞分化成破骨细胞的情况.收集分别培养7、14、21 d细胞进行circRNAs表达谱测序,并比较分析差异表达的circRNAs,选择差异显著的9个cirRNAs进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)验证.验证结果与筛选的circRNA差异性一致的,进行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 地塞米松组培养7、14和21 d后的样本相较于诱导组和对照组形成更大量的破骨细胞.芯片结果显示,与对照组相比,干扰组中共发现3776个差异表达的circRNAs(FC≥2.0,P<0.05),其中574个上调、3202个下调.差异表达的circRNAs主要影响鸟嘌呤-5'-三磷酸GTP酶激活剂的活性、腺苷核糖核苷酸的结合等,对细胞外基质等细胞成分的形成也有影响.RT-PCR表明hsa-circ-006157的表达水平与芯片结果差异最小.构建circRNA-miRNA-mRNA共表达网络,结

作者:王新红;周宗爱;卢璐;郑春茹

来源:中国药物与临床 2022 年 22卷 6期

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王新红;周宗爱;卢璐;郑春茹
来源:
中国药物与临床 2022 年 22卷 6期
标签:
破骨细胞 地塞米松 单核细胞 RNA,环状
目的 筛选糖皮质激素性骨质疏松(GIOP)破骨细胞中差异表达的环状RNA(circRNA),并分析地塞米松对其作用.方法 通过密度差异离心法分离收集9例患者血液中的单核细胞,设置对照组、地塞米松刺激组(1×10-7M地塞米松+50 ng/ml核因子κ-B配体受体致活剂(RANKL)+25 ng/ml人乳腺癌细胞(MCF)-1)和诱导组(50 ng/ml RANKL+25 ng/ml巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF)3个分组,分别诱导分化培养7、14、21 d,观察单核细胞分化成破骨细胞的情况.收集分别培养7、14、21 d细胞进行circRNAs表达谱测序,并比较分析差异表达的circRNAs,选择差异显著的9个cirRNAs进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)验证.验证结果与筛选的circRNA差异性一致的,进行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 地塞米松组培养7、14和21 d后的样本相较于诱导组和对照组形成更大量的破骨细胞.芯片结果显示,与对照组相比,干扰组中共发现3776个差异表达的circRNAs(FC≥2.0,P<0.05),其中574个上调、3202个下调.差异表达的circRNAs主要影响鸟嘌呤-5'-三磷酸GTP酶激活剂的活性、腺苷核糖核苷酸的结合等,对细胞外基质等细胞成分的形成也有影响.RT-PCR表明hsa-circ-006157的表达水平与芯片结果差异最小.构建circRNA-miRNA-mRNA共表达网络,结