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目的:建立一种实时荧光定量逆转录PCR方法,对非小细胞肺癌间变淋巴瘤激酶( ALK)融合基因进行快速、敏感和特异检测。方法首先,应用Primer Premier 5.0软件,针对棘皮动物微管相关蛋白4(EML4)-ALK常见融合变异V1、 V2、 V3a和V3b设计引物和Taqman水解探针。然后,以包含EML4-ALK融合变异V1、 V2、 V3a和V3b的假病毒颗粒为研究对象,进一步分析所建立方法的灵敏度、敏感性和特异性。最后,用所建立的方法检测50例非小细胞肺癌临床标本,其中包含3例ALK-荧光原位杂交( FISH)(+)样本。结果在无背景RNA干扰情况下,建立的实时荧光定量逆转录PCR方法检测灵敏度高达10拷贝/ml。在500拷贝/ml的野生型背景RNA下,其敏感性达1

作者:赵静;赵金银;陈志霞;钟巍;李龙芸;刘利成;胡小许;陈唯军;王孟昭

来源:中国医学科学院学报 2016 年 38卷 6期

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作者:
赵静;赵金银;陈志霞;钟巍;李龙芸;刘利成;胡小许;陈唯军;王孟昭
来源:
中国医学科学院学报 2016 年 38卷 6期
标签:
非小细胞肺癌 棘皮动物微管相关蛋白4-间变淋巴瘤激酶融合基因 实时荧光定量逆转录多聚酶链反应 non-small cell lung cancer echinoderm microtubule associated protein like 4-anaplastic lymphoma kinase fusion gene real-time quantitative reverse transcription polymerase chain reaction
目的:建立一种实时荧光定量逆转录PCR方法,对非小细胞肺癌间变淋巴瘤激酶( ALK)融合基因进行快速、敏感和特异检测。方法首先,应用Primer Premier 5.0软件,针对棘皮动物微管相关蛋白4(EML4)-ALK常见融合变异V1、 V2、 V3a和V3b设计引物和Taqman水解探针。然后,以包含EML4-ALK融合变异V1、 V2、 V3a和V3b的假病毒颗粒为研究对象,进一步分析所建立方法的灵敏度、敏感性和特异性。最后,用所建立的方法检测50例非小细胞肺癌临床标本,其中包含3例ALK-荧光原位杂交( FISH)(+)样本。结果在无背景RNA干扰情况下,建立的实时荧光定量逆转录PCR方法检测灵敏度高达10拷贝/ml。在500拷贝/ml的野生型背景RNA下,其敏感性达1