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目的:利用网络药理学方法,探讨二仙汤治疗乳腺癌的潜在作用机制.方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)收集二仙汤药物的活性成分和其作用靶点,运用GeneCards、OMIM及CTD数据库建立乳腺癌靶点数据库.提炼出二仙汤作用于乳腺癌的交集靶点,运用Cytoscape Version 3.7.1软件和STRING数据库分别绘制"二仙汤活性成分-作用靶点-乳腺癌"网络图和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein Interaction,PPI)网络图,运用R语言相关程序包进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析和基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析,最后运用分子对接验证活性成分与核心靶点的作用强度.结果:二仙汤共有93个活性成分,154个作用靶点,乳腺癌疾病靶点共有364个,中药成分靶点和乳腺癌交集靶点共有40个,具有重要作用的中药成分是槲皮素、山柰酚、异延胡索单酚碱和β-谷甾醇,关键核心靶点有TP53、IL-6和JUN.GO功能富集分析和KEGG通路富集分析共筛选出1502条GO信号通路(P<0.05)和101条KEGG信号通路(P<0.05),主要涉及癌症途径和PI3K-AKT信号通路等.分子对接结果显示,化合物和作用靶点之间具

作者:房立源;李慧杰;王志鹏;李秀荣

来源:中国医院用药评价与分析 2021 年 21卷 8期

知识库介绍

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作者:
房立源;李慧杰;王志鹏;李秀荣
来源:
中国医院用药评价与分析 2021 年 21卷 8期
标签:
二仙汤 乳腺癌 网络药理学 机制预测 分子对接
目的:利用网络药理学方法,探讨二仙汤治疗乳腺癌的潜在作用机制.方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)收集二仙汤药物的活性成分和其作用靶点,运用GeneCards、OMIM及CTD数据库建立乳腺癌靶点数据库.提炼出二仙汤作用于乳腺癌的交集靶点,运用Cytoscape Version 3.7.1软件和STRING数据库分别绘制"二仙汤活性成分-作用靶点-乳腺癌"网络图和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein Interaction,PPI)网络图,运用R语言相关程序包进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析和基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析,最后运用分子对接验证活性成分与核心靶点的作用强度.结果:二仙汤共有93个活性成分,154个作用靶点,乳腺癌疾病靶点共有364个,中药成分靶点和乳腺癌交集靶点共有40个,具有重要作用的中药成分是槲皮素、山柰酚、异延胡索单酚碱和β-谷甾醇,关键核心靶点有TP53、IL-6和JUN.GO功能富集分析和KEGG通路富集分析共筛选出1502条GO信号通路(P<0.05)和101条KEGG信号通路(P<0.05),主要涉及癌症途径和PI3K-AKT信号通路等.分子对接结果显示,化合物和作用靶点之间具