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[目的]基于网络药理学与分子对接方法探讨大陷胸汤治疗急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的药理作用机制.[方法]为获取大陷胸汤的主要化学成分,在中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库、中医药百科全书(Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine,ETCM)数据库、化学专业数据库进行检索并筛选潜在有效化合物,通过Swiss Target Prediction数据库对潜在有效成分进行靶点预测;使用人类基因数据库(Human Gene Database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、DisGeNet数据库、DrugBank数据库获取疾病目标靶点;结合STRING平台获取蛋白互作网络,并对关键靶点蛋白进行网络拓扑学指标分析;运用Metascape数据平台对成分与靶点参与的生物过程及通路进行分析,获取富集分析结果.使用Cytoscape3.7.1软件构建成分、靶点与通路三者间的关联网络,最后通过AutoDock进行分子对接验证.[结果]大陷胸汤中筛选获得70个活性成分,160个作用靶点,1 486个疾病靶点.基因本体(gene ontology,GO)富集分析中生物过程包含细胞对氮化合物的反应、肽反应、激酶活性调节、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated prote

作者:曾程;刘同亭

来源:浙江中医药大学学报 2023 年 47卷 6期

知识库介绍

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作者:
曾程;刘同亭
来源:
浙江中医药大学学报 2023 年 47卷 6期
标签:
大陷胸汤 急性胰腺炎 网络药理学 分子对接 靶点预测 信号通路 作用机制
[目的]基于网络药理学与分子对接方法探讨大陷胸汤治疗急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的药理作用机制.[方法]为获取大陷胸汤的主要化学成分,在中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库、中医药百科全书(Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine,ETCM)数据库、化学专业数据库进行检索并筛选潜在有效化合物,通过Swiss Target Prediction数据库对潜在有效成分进行靶点预测;使用人类基因数据库(Human Gene Database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、DisGeNet数据库、DrugBank数据库获取疾病目标靶点;结合STRING平台获取蛋白互作网络,并对关键靶点蛋白进行网络拓扑学指标分析;运用Metascape数据平台对成分与靶点参与的生物过程及通路进行分析,获取富集分析结果.使用Cytoscape3.7.1软件构建成分、靶点与通路三者间的关联网络,最后通过AutoDock进行分子对接验证.[结果]大陷胸汤中筛选获得70个活性成分,160个作用靶点,1 486个疾病靶点.基因本体(gene ontology,GO)富集分析中生物过程包含细胞对氮化合物的反应、肽反应、激酶活性调节、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated prote