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目的 运用网络药理学和分子对接的方法揭示延龄草治疗心肌缺血的作用机制.方法 采用TCMID、TCM@TAI-WAN、BATMAN-TCM数据库,并在PubMed、中国知网、万方数据库进行文献挖掘,获取延龄草活性成分;从PharmMap-per数据库收集成分靶点,从 DISGeNET、GeneCards、Drug-Bank、OMIM数据库收集心肌缺血靶点,获取延龄草治疗心肌缺血的预测靶点;采用String数据库获取蛋白-蛋白相互作用关系,运用Cytoscape3. 7. 2软件构建延龄草的成分-作用靶点图和PPI 网络,通过RStudio 软件进行 GO 和 KEGG 通路的富集分析,并采用分子对接对预测结果进行验证.结果 筛选得到 10 个主要活性成分,ALB、EGFR、MAPK1、CASP3、ESR1 等13个抗心肌缺血核心靶点,参与调控28 条心肌缺血相关的信号通路.分子对接结果显示延龄草主要活性成分与核心靶点具有较好的结合活性.结论 延龄草治疗心肌缺血的作用机制可通过多成分-多靶点-多通路的综合作用而实现.

作者:赵永恒;李成刚;戈振凯;谢秋雨;栾思琪;郝新才;王佰灵

来源:中国药理学通报 2022 年 38卷 6期

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赵永恒;李成刚;戈振凯;谢秋雨;栾思琪;郝新才;王佰灵
来源:
中国药理学通报 2022 年 38卷 6期
标签:
网络药理学 分子对接 延龄草 心肌缺血 作用机制 信号通路
目的 运用网络药理学和分子对接的方法揭示延龄草治疗心肌缺血的作用机制.方法 采用TCMID、TCM@TAI-WAN、BATMAN-TCM数据库,并在PubMed、中国知网、万方数据库进行文献挖掘,获取延龄草活性成分;从PharmMap-per数据库收集成分靶点,从 DISGeNET、GeneCards、Drug-Bank、OMIM数据库收集心肌缺血靶点,获取延龄草治疗心肌缺血的预测靶点;采用String数据库获取蛋白-蛋白相互作用关系,运用Cytoscape3. 7. 2软件构建延龄草的成分-作用靶点图和PPI 网络,通过RStudio 软件进行 GO 和 KEGG 通路的富集分析,并采用分子对接对预测结果进行验证.结果 筛选得到 10 个主要活性成分,ALB、EGFR、MAPK1、CASP3、ESR1 等13个抗心肌缺血核心靶点,参与调控28 条心肌缺血相关的信号通路.分子对接结果显示延龄草主要活性成分与核心靶点具有较好的结合活性.结论 延龄草治疗心肌缺血的作用机制可通过多成分-多靶点-多通路的综合作用而实现.