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目的:通过网络药理学和分子对接技术,探讨芪黄通秘软胶囊治疗便秘的作用机制.方法:依托中药系统药理学数据库与分析平台、TCM Database@Taiwan等数据库,检索芪黄通秘软胶囊中 11 味中药的化学成分及其靶点,构建成分-靶点网络,通过DrugBank、GeneCards等数据库检索便秘相关靶点,依托STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并利用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用R语言进行结果可视化,将药物关键化学成分与核心靶点导入AutoDockTools 1.5.7 软件计算其结合能并进行分子对接.结果:共筛选出124 个化学成分和 113 个疾病靶点,槲皮素、山柰酚等成分在网络中处于关键地位;PPI网络中度值排序居前 3 位的蛋白分别为蛋白激酶B1、肿瘤蛋白p53 和表皮生长因子受体;GO功能富集分析结果显示,102 个条目中,有 55 个涉及生物过程,31 个涉及分子功能,16 个涉及细胞组分;KEGG通路富集分析结果显示,115 个通路主要集中在内分泌耐药、丝裂原激活的蛋白激酶信号通路上;分子对接结合能均<-20.92 kJ/mol.结论:本研究揭示了芪黄通秘软胶囊治疗便秘的部分机制,为深入开展芪黄通秘软胶囊的临床相关研究及应用提供了参考和借鉴.

作者:金政森;翟弋焱;郭思宇;高艺菲;陶晓宇;张景媛;张繁芹;陆珊;赵若琪;吴嘉瑞

来源:中国医院用药评价与分析 2023 年 23卷 11期

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作者:
金政森;翟弋焱;郭思宇;高艺菲;陶晓宇;张景媛;张繁芹;陆珊;赵若琪;吴嘉瑞
来源:
中国医院用药评价与分析 2023 年 23卷 11期
标签:
网络药理学 分子对接 芪黄通秘软胶囊 便秘 Network pharmacology Molecular docking Qihuang Tongmi soft capsules Constipation
目的:通过网络药理学和分子对接技术,探讨芪黄通秘软胶囊治疗便秘的作用机制.方法:依托中药系统药理学数据库与分析平台、TCM Database@Taiwan等数据库,检索芪黄通秘软胶囊中 11 味中药的化学成分及其靶点,构建成分-靶点网络,通过DrugBank、GeneCards等数据库检索便秘相关靶点,依托STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并利用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用R语言进行结果可视化,将药物关键化学成分与核心靶点导入AutoDockTools 1.5.7 软件计算其结合能并进行分子对接.结果:共筛选出124 个化学成分和 113 个疾病靶点,槲皮素、山柰酚等成分在网络中处于关键地位;PPI网络中度值排序居前 3 位的蛋白分别为蛋白激酶B1、肿瘤蛋白p53 和表皮生长因子受体;GO功能富集分析结果显示,102 个条目中,有 55 个涉及生物过程,31 个涉及分子功能,16 个涉及细胞组分;KEGG通路富集分析结果显示,115 个通路主要集中在内分泌耐药、丝裂原激活的蛋白激酶信号通路上;分子对接结合能均<-20.92 kJ/mol.结论:本研究揭示了芪黄通秘软胶囊治疗便秘的部分机制,为深入开展芪黄通秘软胶囊的临床相关研究及应用提供了参考和借鉴.