目的：应用生物信息学分析A549细胞中在CD133阳性低表达的miR-29b的靶基因及其功能，为以miR-29b为靶点的肿瘤研究提供线索。方法：利用miRNA PCR芯片筛选A549细胞中CD133阳性和CD133阴性差异表达的miRNA，选用miRecords预测miR-29b的靶基因，合并已证实的靶基因，利用GOEAST和DAVID数据库对所得靶基因进行功能富集分析和信号转导通路富集分析。结果：A549细胞中与CD133阴性比较，miR-29b在CD133阳性中表达下调。miR-29b靶基因有106个，其靶基因功能富集于结合和细胞外基质形成等作用（P<0.01）；信号转导通路显著富集于JAK-STAT和TGF-β等信号转导通路（P<0.05）。结论：miR-29b可能与肺癌转移相关，miR-29b的靶基因显著富集在与肿瘤相关的信号通路中。
作者：王红艳；郑少秋；涂永生；张雅洁
来源：中国肿瘤临床 2014 年 16期
