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目的 利用生物信息学分析鲁索利替尼、托法替尼对斑秃(AA)小鼠皮损皮肤组织的基因表达的影响,为酪氨酸激酶(JAK)抑制剂治疗AA的临床应用及其机制研究提供参考.方法 在PubMed GEO DataSets中下载基因芯片数据GSE45514(ID:5273),采用R软件、Cytoscape软件、STRING 11.0、基因信息分析平台(GCBI)基因雷达分析等分析软件,筛选鲁索利替尼、托法替尼干预AA小鼠12周后皮损皮肤组织较干预前共同的差异表达基因,探讨差异基因的蛋白-蛋白相互作用、涉及的生物学功能和信号通路以及关键基因等.结果 AA小鼠经鲁索利替尼、托法替尼干预12周后皮损皮肤组织中有18个共同的显著差异表达基因,主要参与免疫系统过程调节、免疫应答、趋化因子介导信号通路等生物过程.CCL5为蛋白网络核心节点,可激活下游基因CCR1~10、CXCR1~6、XCR1、CX3CR1,与炎性反应、自身免疫性疾病等相关,经2种药物治疗后皮损皮肤组织中表达明显降低.结论 通过生物信息学分析发现JAK抑制剂可使AA小鼠皮损皮肤组织中基因表达谱发生改变,其可能通过下调CCL5基因表达促进AA的好转.

作者:王小莉;王用峰;连莉阳;王李雯;屈煦;张荣强;张志刚

来源:中国中西医结合皮肤性病学杂志 2021 年 20卷 3期

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作者:
王小莉;王用峰;连莉阳;王李雯;屈煦;张荣强;张志刚
来源:
中国中西医结合皮肤性病学杂志 2021 年 20卷 3期
标签:
斑秃 酪氨酸激酶抑制剂 生物信息学 基因表达 信号通路
目的 利用生物信息学分析鲁索利替尼、托法替尼对斑秃(AA)小鼠皮损皮肤组织的基因表达的影响,为酪氨酸激酶(JAK)抑制剂治疗AA的临床应用及其机制研究提供参考.方法 在PubMed GEO DataSets中下载基因芯片数据GSE45514(ID:5273),采用R软件、Cytoscape软件、STRING 11.0、基因信息分析平台(GCBI)基因雷达分析等分析软件,筛选鲁索利替尼、托法替尼干预AA小鼠12周后皮损皮肤组织较干预前共同的差异表达基因,探讨差异基因的蛋白-蛋白相互作用、涉及的生物学功能和信号通路以及关键基因等.结果 AA小鼠经鲁索利替尼、托法替尼干预12周后皮损皮肤组织中有18个共同的显著差异表达基因,主要参与免疫系统过程调节、免疫应答、趋化因子介导信号通路等生物过程.CCL5为蛋白网络核心节点,可激活下游基因CCR1~10、CXCR1~6、XCR1、CX3CR1,与炎性反应、自身免疫性疾病等相关,经2种药物治疗后皮损皮肤组织中表达明显降低.结论 通过生物信息学分析发现JAK抑制剂可使AA小鼠皮损皮肤组织中基因表达谱发生改变,其可能通过下调CCL5基因表达促进AA的好转.