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目的:利用网络药理学手段探讨西黄丸抑制三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)的关键分子靶点及其免疫学机制.方法:利用TCMSP数据库对西黄丸组分药物作用靶点进行筛选,OMIM数据库、Genecard数据库以及TCGA数据库用于筛选三阴性乳腺癌的病理靶点,使用STRING在线数据库11.0对西黄丸抗三阴性乳腺癌作用靶点进行评估,Cytoscape软件可视化生成一个靶-靶功能相关蛋白网络、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,利用R包"clusterprofiler"对核心靶点进行GO富集和KEGG通路分析,使用CIBERSORT算法对三阴性乳腺癌患者RNA-seq数据进行分析,并对基因表达量以及免疫细胞含量进行spearman相关性分析.结果:确定西黄丸干预乳腺癌的关键靶点4个,即上调CXC趋化因子配体10(chemokine ligand-10,CXCL10)、腺病毒E2启动子转录因子1(E2F transcription factor 1,E2F1)、下调AP-1转录因子亚单位(AP-1 transcription factor subunit,FOS)、凝血因子3(coagulation factorⅢ,F3),关键基因GO富集分析筛选得到GO条目25条,KEGG富集4个核心基因主要涉及信号通路11条.CXCL10与记忆T细胞活化正相关,与M2型巨噬细胞表达负相关;E2F1与滤泡型辅助T细胞(follicular helper T cell,Tfh)表达正相关,与静止记忆T细胞负相关;F3与静止树突

作者:郭秋均;孙其伟

来源:中国中医基础医学杂志 2021 年 27卷 12期

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作者:
郭秋均;孙其伟
来源:
中国中医基础医学杂志 2021 年 27卷 12期
标签:
西黄丸;三阴性乳腺癌;网络药理学
目的:利用网络药理学手段探讨西黄丸抑制三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)的关键分子靶点及其免疫学机制.方法:利用TCMSP数据库对西黄丸组分药物作用靶点进行筛选,OMIM数据库、Genecard数据库以及TCGA数据库用于筛选三阴性乳腺癌的病理靶点,使用STRING在线数据库11.0对西黄丸抗三阴性乳腺癌作用靶点进行评估,Cytoscape软件可视化生成一个靶-靶功能相关蛋白网络、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,利用R包"clusterprofiler"对核心靶点进行GO富集和KEGG通路分析,使用CIBERSORT算法对三阴性乳腺癌患者RNA-seq数据进行分析,并对基因表达量以及免疫细胞含量进行spearman相关性分析.结果:确定西黄丸干预乳腺癌的关键靶点4个,即上调CXC趋化因子配体10(chemokine ligand-10,CXCL10)、腺病毒E2启动子转录因子1(E2F transcription factor 1,E2F1)、下调AP-1转录因子亚单位(AP-1 transcription factor subunit,FOS)、凝血因子3(coagulation factorⅢ,F3),关键基因GO富集分析筛选得到GO条目25条,KEGG富集4个核心基因主要涉及信号通路11条.CXCL10与记忆T细胞活化正相关,与M2型巨噬细胞表达负相关;E2F1与滤泡型辅助T细胞(follicular helper T cell,Tfh)表达正相关,与静止记忆T细胞负相关;F3与静止树突