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目的 探寻散寒化湿宣肺方(SHXF)中抗新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的活性化合物.方法 借助TC?MSP等数据库检索SHXF方中苍术、陈皮、厚朴、藿香、草果、生麻黄、羌活、生姜、槟榔所含化学成分与作用靶点.通过Cytoscape软件绘制化合物-靶点网络图和PPI网络图对化合物和靶点进行拓扑分析.采用DAVID 6.7数据库对靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析;利用AutoDock Vina对SHXF关键化合物与SARS-CoV-23CL水解酶和Nsp15蛋白进行分子对接.结果 经筛选获得SHXF共85个活性化合物与214个作用靶点,关键靶点涉及Akt1、IL-6、MAPK3、VEGFA、JUN等.GO富集分析得到功能条目599个(P<0.05),其中生物过程(BP)460个,细胞组成(CC)55个,分子功能(MF)84个.KEGG通路获得113条(P<0.05),主要涉及甲型流感(Influenza A)信号通路、TLR(Toll-like receptor)信号通路、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路等.分子对接结果显示SHXF中槲皮素、柚皮素、谷甾醇等核心化合物与瑞德西韦等推荐用药亲和力相似.结论 SHXF中的槲皮素、柚皮素、谷甾醇等核心化合物可与SARS-CoV-23CL水解酶和Nsp15蛋白结合,或为治疗新型冠状病毒肺炎的活性化合物.

作者:杜帅琳;王玉;张玲;万海同

来源:中国中医急症 2020 年 29卷 12期

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作者:
杜帅琳;王玉;张玲;万海同
来源:
中国中医急症 2020 年 29卷 12期
标签:
新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 网络药理学 分子对接
目的 探寻散寒化湿宣肺方(SHXF)中抗新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的活性化合物.方法 借助TC?MSP等数据库检索SHXF方中苍术、陈皮、厚朴、藿香、草果、生麻黄、羌活、生姜、槟榔所含化学成分与作用靶点.通过Cytoscape软件绘制化合物-靶点网络图和PPI网络图对化合物和靶点进行拓扑分析.采用DAVID 6.7数据库对靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析;利用AutoDock Vina对SHXF关键化合物与SARS-CoV-23CL水解酶和Nsp15蛋白进行分子对接.结果 经筛选获得SHXF共85个活性化合物与214个作用靶点,关键靶点涉及Akt1、IL-6、MAPK3、VEGFA、JUN等.GO富集分析得到功能条目599个(P<0.05),其中生物过程(BP)460个,细胞组成(CC)55个,分子功能(MF)84个.KEGG通路获得113条(P<0.05),主要涉及甲型流感(Influenza A)信号通路、TLR(Toll-like receptor)信号通路、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路等.分子对接结果显示SHXF中槲皮素、柚皮素、谷甾醇等核心化合物与瑞德西韦等推荐用药亲和力相似.结论 SHXF中的槲皮素、柚皮素、谷甾醇等核心化合物可与SARS-CoV-23CL水解酶和Nsp15蛋白结合,或为治疗新型冠状病毒肺炎的活性化合物.