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目的 运用网络药理学和分子对接方法,预测荆防败毒散预防新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的活性成分,为临床用药提供参考.方法 通过中药系统药理学分析平台,检索荆防败毒散组方中所有药材的化学成分和作用靶点.通过Uniprot数据库校正靶点对应的基因,利用Cytoscape软件构建药材-成分-靶点网络并进行可视化处理,利用疾病数据库检索COVID-19相关的靶点,筛选出重合的靶点,通过String数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络.通过Metascape进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,预测其作用机制,通过分子对接,计算核心成分在预防新型冠状病毒肺炎的作用强度.结果 限定筛选条件为口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18,共得到荆防败毒散的159个活性成分和277个靶点,与获得的273个COVID-19相关的靶点取交集,得到55个核心靶点;对核心靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,得到GO条目1376个和136条信号通路,涉及感染性疾病、癌症、细胞进程、免疫系统、信号等通路.分子对接结果显示荆防败毒散核心成分与SARS-CoV-23CL水解酶、血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)具有较强的结合能力,结合形式有氢键、疏水作用.结论 荆防败毒散中的活性成分能通过抑制新型冠状病毒(SARS-CoV-2)蛋白,ACE2结合,通过对多靶点、多通路的作用发挥对COVID-19

作者:冯群;关永霞;黄志艳;叶士莉;程国良;姚景春;张贵民

来源:药学实践杂志 2020 年 38卷 6期

知识库介绍

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作者:
冯群;关永霞;黄志艳;叶士莉;程国良;姚景春;张贵民
来源:
药学实践杂志 2020 年 38卷 6期
标签:
荆防败毒散 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 网络药理学 分子对接
目的 运用网络药理学和分子对接方法,预测荆防败毒散预防新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的活性成分,为临床用药提供参考.方法 通过中药系统药理学分析平台,检索荆防败毒散组方中所有药材的化学成分和作用靶点.通过Uniprot数据库校正靶点对应的基因,利用Cytoscape软件构建药材-成分-靶点网络并进行可视化处理,利用疾病数据库检索COVID-19相关的靶点,筛选出重合的靶点,通过String数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络.通过Metascape进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,预测其作用机制,通过分子对接,计算核心成分在预防新型冠状病毒肺炎的作用强度.结果 限定筛选条件为口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18,共得到荆防败毒散的159个活性成分和277个靶点,与获得的273个COVID-19相关的靶点取交集,得到55个核心靶点;对核心靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,得到GO条目1376个和136条信号通路,涉及感染性疾病、癌症、细胞进程、免疫系统、信号等通路.分子对接结果显示荆防败毒散核心成分与SARS-CoV-23CL水解酶、血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)具有较强的结合能力,结合形式有氢键、疏水作用.结论 荆防败毒散中的活性成分能通过抑制新型冠状病毒(SARS-CoV-2)蛋白,ACE2结合,通过对多靶点、多通路的作用发挥对COVID-19