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目的 筛选职业性尘肺病(以下简称"尘肺病")患者血清中差异表达微小RNA(miRNA),通过生物信息学分析其潜在靶基因和相关转录因子.方法 从谷歌学术网站检索尘肺病和miRNA的相关研究报道,选择以尘肺病病人(病例组)和正常健康人(对照组)血清样品为基础的miRNA测序或高通量芯片数据集,筛选差异表达miRNAs.采集职业性矽肺病人和健康对照人群血清样品,以实时荧光定量聚合酶链式反应法检测miRNAs相对表达水平,进行差异表达miRNAs验证.采用miRWalk数据库对筛选出的差异表达miRNAs的靶基因进行预测,对靶基因进行基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路预测和转录因子分析.结果 共筛选和验证出7个差异表达的miRNAs;其中,上调的miRNAs有5个,下调的miRNAs有2个.GO富集分析和KEGG信号通路预测结果显示:上调的差异表达miRNAs主要与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录和细胞外基质有关,主要通过黏着斑、蛋白消化和吸收、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B和转化生长因子-β等信号通路参与肺纤维化的发生发展;下调的2个差异表达miRNAs主要与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录和DNA序列特异性转录因子活性有关,主要通过相关激素释放的信号通路参与肺纤维化的发生和发展.转录因子注释结果显示:SMAD家族成员3、原癌基因JUN、叉头状转

作者:杨果;祁远梦;杨培琰;李超;魏静静;姚武;郝长付

来源:中国职业医学 2021 年 48卷 2期

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作者:
杨果;祁远梦;杨培琰;李超;魏静静;姚武;郝长付
来源:
中国职业医学 2021 年 48卷 2期
标签:
尘肺病 矽肺 肺纤维化 血清 miRNA 差异表达 转录因子 生物信息学
目的 筛选职业性尘肺病(以下简称"尘肺病")患者血清中差异表达微小RNA(miRNA),通过生物信息学分析其潜在靶基因和相关转录因子.方法 从谷歌学术网站检索尘肺病和miRNA的相关研究报道,选择以尘肺病病人(病例组)和正常健康人(对照组)血清样品为基础的miRNA测序或高通量芯片数据集,筛选差异表达miRNAs.采集职业性矽肺病人和健康对照人群血清样品,以实时荧光定量聚合酶链式反应法检测miRNAs相对表达水平,进行差异表达miRNAs验证.采用miRWalk数据库对筛选出的差异表达miRNAs的靶基因进行预测,对靶基因进行基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路预测和转录因子分析.结果 共筛选和验证出7个差异表达的miRNAs;其中,上调的miRNAs有5个,下调的miRNAs有2个.GO富集分析和KEGG信号通路预测结果显示:上调的差异表达miRNAs主要与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录和细胞外基质有关,主要通过黏着斑、蛋白消化和吸收、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B和转化生长因子-β等信号通路参与肺纤维化的发生发展;下调的2个差异表达miRNAs主要与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录和DNA序列特异性转录因子活性有关,主要通过相关激素释放的信号通路参与肺纤维化的发生和发展.转录因子注释结果显示:SMAD家族成员3、原癌基因JUN、叉头状转