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该研究利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从雷公藤悬浮细胞中克隆得到一条GGPPS全长cDNA(GeneBank:KM978333),并对其进行多重序列比对、蛋白结构预测及构建系统进化树等生物信息学分析.所克隆的TwGGPPS cDNA全长1 857 bp,编码含514个氨基酸的蛋白序列,相对分子质量为57.13 kDa,等电点为7.85,具有5个保守域和2个功能域,亚细胞定位预测显示其可能位于质膜上,多重序列比对及系统进化树结果显示与其他植物GGPPS家族具有较高同源性.实验首次克隆了雷公藤GGPPS基因,为进一步研究雷公藤甲素等二萜化合物生物合成途径奠定基础.

作者:张萌;苏平;刘雨佳;童宇茹;赵瑜君;高伟;王秀娟;黄璐琦

来源:中国中药杂志 2015 年 40卷 6期

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作者:
张萌;苏平;刘雨佳;童宇茹;赵瑜君;高伟;王秀娟;黄璐琦
来源:
中国中药杂志 2015 年 40卷 6期
标签:
雷公藤 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶 克隆 生物信息学分析 Tripterygium wilfordii GGPPS clone bioinformatics analysis
该研究利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从雷公藤悬浮细胞中克隆得到一条GGPPS全长cDNA(GeneBank:KM978333),并对其进行多重序列比对、蛋白结构预测及构建系统进化树等生物信息学分析.所克隆的TwGGPPS cDNA全长1 857 bp,编码含514个氨基酸的蛋白序列,相对分子质量为57.13 kDa,等电点为7.85,具有5个保守域和2个功能域,亚细胞定位预测显示其可能位于质膜上,多重序列比对及系统进化树结果显示与其他植物GGPPS家族具有较高同源性.实验首次克隆了雷公藤GGPPS基因,为进一步研究雷公藤甲素等二萜化合物生物合成途径奠定基础.