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通过网络药理学方法探讨逍遥散对动脉粥样硬化和抑郁症的"异病同治"的作用机制.通过TCMSP (Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)、SymMap数据库检索逍遥散中8味中药相关的所有化学成分和作用靶点,经初步筛选后构建"中药-化合物-靶点"作用网络,通过DisGeNET、CTD(Comparative Toxicogenomics Database)和TTD(Therapeutic Target Database)数据库获取动脉粥样硬化和抑郁症的相关基因,将药物作用靶点和疾病基因靶点整合获得共有靶点,使用STRING 11.0和Cytoscape进行共有靶点的蛋白质间相互作用分析筛选关键共有靶点,应用BioGPS获取其在器官组织的分布信息,并使用Metascape对关键共有靶点进行基因本体(gene ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析.结果 显示,检索到逍遥散化合物共1 355个,据口服生物利用度≥30%和类药性指数≥0.18标准筛选出161个活性化合物,获得274个药物作用靶点,构建"中药-化合物-靶点"作用网络;检索到动脉粥样硬化疾病基因靶点共1 004个,抑郁症578个,通过与药物作用靶点取交集后获得37个共有靶点;使用STRING和Cytoscape进行共有靶点的蛋白质间相互作用分析筛选关键共有靶点18

作者:陈铭泰;肖娇;林海丹;李颖;黎美欢;栾杰男;张忠

来源:中国中药杂志 2020 年 45卷 17期

知识库介绍

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作者:
陈铭泰;肖娇;林海丹;李颖;黎美欢;栾杰男;张忠
来源:
中国中药杂志 2020 年 45卷 17期
标签:
网络药理学 逍遥散 动脉粥样硬化 抑郁症 异病同治
通过网络药理学方法探讨逍遥散对动脉粥样硬化和抑郁症的"异病同治"的作用机制.通过TCMSP (Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)、SymMap数据库检索逍遥散中8味中药相关的所有化学成分和作用靶点,经初步筛选后构建"中药-化合物-靶点"作用网络,通过DisGeNET、CTD(Comparative Toxicogenomics Database)和TTD(Therapeutic Target Database)数据库获取动脉粥样硬化和抑郁症的相关基因,将药物作用靶点和疾病基因靶点整合获得共有靶点,使用STRING 11.0和Cytoscape进行共有靶点的蛋白质间相互作用分析筛选关键共有靶点,应用BioGPS获取其在器官组织的分布信息,并使用Metascape对关键共有靶点进行基因本体(gene ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析.结果 显示,检索到逍遥散化合物共1 355个,据口服生物利用度≥30%和类药性指数≥0.18标准筛选出161个活性化合物,获得274个药物作用靶点,构建"中药-化合物-靶点"作用网络;检索到动脉粥样硬化疾病基因靶点共1 004个,抑郁症578个,通过与药物作用靶点取交集后获得37个共有靶点;使用STRING和Cytoscape进行共有靶点的蛋白质间相互作用分析筛选关键共有靶点18