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基于GC-MS技术和网络药理学方法研究益智仁挥发油治疗阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的物质基础和作用机制.利用GC-MS技术分析益智仁挥发油成分,通过中药系统药理学分析数据库(TCMSP)获取成分靶点,再通过Drug-Bank、STITCH、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)等数据库查询AD的相关靶点.在Venny图取交集靶点,STRING数据库构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,筛选核心作用靶点.基于DAVID数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.采用Cytoscape 3.8.1软件构建"成分-靶点-通路"网络,筛选益智仁挥发油治疗AD的潜在活性成分,结合已有的益智仁挥发油治疗AD的药理学研究预测其机制.结果显示,GC-MS分析所得的益智仁挥发油成分经筛选后得到6个活性成分,TCMSP数据库中检索到6个活性成分对应的17个靶点,DrugBank等数据库检索到3448个AD靶点."成分-靶点-通路"网络和PPI网络显示益智仁挥发油治疗AD的潜在活性成分有4种,核心靶点有4个;GO富集分析得到34个条目(P<0.05),包含生物过程18条、细胞组成9条和分子功能7条;KEGG通路富集到5个条目(P<0.05),这些通路主要涉及神经活性配体-受体相互作用、钙离子信号通路、胆碱能突触、5-羟色胺能突触等,表明益智仁

作者:李文静;肖帅;郑琴;朱丽云;张明霞;杨明;闫悦;王子怡

来源:中国中药杂志 2021 年 46卷 12期

知识库介绍

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李文静;肖帅;郑琴;朱丽云;张明霞;杨明;闫悦;王子怡
来源:
中国中药杂志 2021 年 46卷 12期
标签:
网络药理学 益智仁挥发油 阿尔茨海默病 机制 GC-MS
基于GC-MS技术和网络药理学方法研究益智仁挥发油治疗阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的物质基础和作用机制.利用GC-MS技术分析益智仁挥发油成分,通过中药系统药理学分析数据库(TCMSP)获取成分靶点,再通过Drug-Bank、STITCH、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)等数据库查询AD的相关靶点.在Venny图取交集靶点,STRING数据库构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,筛选核心作用靶点.基于DAVID数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.采用Cytoscape 3.8.1软件构建"成分-靶点-通路"网络,筛选益智仁挥发油治疗AD的潜在活性成分,结合已有的益智仁挥发油治疗AD的药理学研究预测其机制.结果显示,GC-MS分析所得的益智仁挥发油成分经筛选后得到6个活性成分,TCMSP数据库中检索到6个活性成分对应的17个靶点,DrugBank等数据库检索到3448个AD靶点."成分-靶点-通路"网络和PPI网络显示益智仁挥发油治疗AD的潜在活性成分有4种,核心靶点有4个;GO富集分析得到34个条目(P<0.05),包含生物过程18条、细胞组成9条和分子功能7条;KEGG通路富集到5个条目(P<0.05),这些通路主要涉及神经活性配体-受体相互作用、钙离子信号通路、胆碱能突触、5-羟色胺能突触等,表明益智仁