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利用网络药理学和分子对接的方法探讨经典名方滋膵饮治疗糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)的潜在作用机制.通过检索 DrugBank、Therapeutic Target Database(TTD)、Online Mendelian Inheritance in Man Database(OMIM)、Gene-Cards、DisGeNET、Comparative Toxicogenomics Database(CTD)、PharmGKB 等数据库收集 DKD 相关靶点,利用 SwissTargetPredic-tion数据库预测滋膵饮12个入血活性成分的作用靶点,将二者进行映射获得潜在靶点;运用Cytoscape 3.8.2软件构建"滋膵饮入血活性成分-潜在靶点-糖尿病肾病"网络;使用STRING数据库构建靶蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;利用 DAVID V6.8 平台对关键靶点进行 GO(Gene Ontology)和 KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析,研究其作用机制.利用PyMOL和AutoDock Vina等软件对滋膵饮关键入血活性成分和核心靶蛋白进行分子对接.结果显示,滋膵饮的12个入血活性成分共预测并筛选出173个药物靶点,检索到DKD相关的基因靶点6 756个,将二者进行映射,筛选出124个潜在靶点,其中滋膵饮治疗DKD的关键靶点26个,核心靶点3个.GO功能富集分析得到34个条目(P≤0.01,且benjamini≤0.01),滋膵饮治疗DKD与ERK级联反应,细胞凋亡、增殖、迁

作者:高利东;刘佳;黄宇虹;王保和

来源:中国中药杂志 2022 年 47卷 12期

知识库介绍

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作者:
高利东;刘佳;黄宇虹;王保和
来源:
中国中药杂志 2022 年 47卷 12期
标签:
网络药理学 糖尿病肾病 滋膵饮 作用机制
利用网络药理学和分子对接的方法探讨经典名方滋膵饮治疗糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)的潜在作用机制.通过检索 DrugBank、Therapeutic Target Database(TTD)、Online Mendelian Inheritance in Man Database(OMIM)、Gene-Cards、DisGeNET、Comparative Toxicogenomics Database(CTD)、PharmGKB 等数据库收集 DKD 相关靶点,利用 SwissTargetPredic-tion数据库预测滋膵饮12个入血活性成分的作用靶点,将二者进行映射获得潜在靶点;运用Cytoscape 3.8.2软件构建"滋膵饮入血活性成分-潜在靶点-糖尿病肾病"网络;使用STRING数据库构建靶蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;利用 DAVID V6.8 平台对关键靶点进行 GO(Gene Ontology)和 KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析,研究其作用机制.利用PyMOL和AutoDock Vina等软件对滋膵饮关键入血活性成分和核心靶蛋白进行分子对接.结果显示,滋膵饮的12个入血活性成分共预测并筛选出173个药物靶点,检索到DKD相关的基因靶点6 756个,将二者进行映射,筛选出124个潜在靶点,其中滋膵饮治疗DKD的关键靶点26个,核心靶点3个.GO功能富集分析得到34个条目(P≤0.01,且benjamini≤0.01),滋膵饮治疗DKD与ERK级联反应,细胞凋亡、增殖、迁