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基于网络药理学、分子对接以及实验验证探讨山豆根治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的作用机制.首先通过TCMSP和TCMID等数据库以及相关文献查找山豆根的主要化学成分;借助TCMSP和SwissTargetPrediction等数据库查找山豆根主要作用靶点;通过GeneCardsDrugBank、OMIM和TTD等数据库获取RA的主要靶点;选择Venny 2.1.0平台获取两者的交集靶点;通过Cytoscape 3.6.1软件构建"成分-靶点"网络;利用STRING平台和Cytoscape 3.6.1软件构建蛋白互作网络;随后通过DAVID 6.8数据库进行生物过程富集分析和通路富集分析;利用AutoDock Vina软件进行分子对接验证.最后构建胶原诱导型类风湿性关节炎小鼠模型,采用Western blot实验检测核心靶点蛋白表达.网络分析结果得到槲皮素(quercetin)、染料木素(genistein)、山柰酚(kaempferol)、大豆皂苷C(subprogenin C)和黄豆苷元(daidzein)等27个活性成分,信号转导和转录活化因子 3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、丝裂原活化蛋白激酶 1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、转录因子 AP-1(AP-1 transcription factor subunit,JUN)和白细胞介素6(interleukin 6,IL6)等154个治疗靶点,初步

作者:祝盼盼;戚明珠;杨京航;陶雪莹;林娜;苏晓慧;孔祥英

来源:中国中药杂志 2022 年 47卷 19期

知识库介绍

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祝盼盼;戚明珠;杨京航;陶雪莹;林娜;苏晓慧;孔祥英
来源:
中国中药杂志 2022 年 47卷 19期
标签:
山豆根 类风湿性关节炎 网络药理学 分子对接 体内验证 胶原诱导型类风湿性关节炎
基于网络药理学、分子对接以及实验验证探讨山豆根治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的作用机制.首先通过TCMSP和TCMID等数据库以及相关文献查找山豆根的主要化学成分;借助TCMSP和SwissTargetPrediction等数据库查找山豆根主要作用靶点;通过GeneCardsDrugBank、OMIM和TTD等数据库获取RA的主要靶点;选择Venny 2.1.0平台获取两者的交集靶点;通过Cytoscape 3.6.1软件构建"成分-靶点"网络;利用STRING平台和Cytoscape 3.6.1软件构建蛋白互作网络;随后通过DAVID 6.8数据库进行生物过程富集分析和通路富集分析;利用AutoDock Vina软件进行分子对接验证.最后构建胶原诱导型类风湿性关节炎小鼠模型,采用Western blot实验检测核心靶点蛋白表达.网络分析结果得到槲皮素(quercetin)、染料木素(genistein)、山柰酚(kaempferol)、大豆皂苷C(subprogenin C)和黄豆苷元(daidzein)等27个活性成分,信号转导和转录活化因子 3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、丝裂原活化蛋白激酶 1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、转录因子 AP-1(AP-1 transcription factor subunit,JUN)和白细胞介素6(interleukin 6,IL6)等154个治疗靶点,初步