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目的 了解肝细胞癌(HCC)中HBV DNA的整合情况.方法 收集24例HBsAg阳性患者的HCC组织,提取其DNA,应用套式PCR原理,在设计的引物中引入U碱基,根据已知基因序列和人Alu重复序列分别设计引物,建立克隆整合的HBV DNA及其相邻的细胞基因序列的PCR技术.PCR产物测序所获结果经美国国家生物技术信息中心(NCBI)BLAST及Map Viewer检索确定HBV整合在染色体上的精确位置.结果 24份HCC组织中,14份存在HBV整合现象,整合的标本中11份正向插入宿主基因,8份反向插入宿主基因,其中5份标本既有正向插入也有反向插入,从病毒基因分析,整合可发生于X基因的任何长度,且均以截短形式插入宿主细胞DNA.另有8份标本未测到整合.结论 HBV在HCC细胞染色体上的整合呈不均衡分布.

作者:解俊侠;张亚飞;谢琴秀;郜玉锋;胡立芬;李家斌;李旭

来源:中华传染病杂志 2008 年 26卷 4期

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作者:
解俊侠;张亚飞;谢琴秀;郜玉锋;胡立芬;李家斌;李旭
来源:
中华传染病杂志 2008 年 26卷 4期
标签:
Alu元件 肝炎病毒,乙型 病毒整合 癌,肝细胞 DNA,病毒 Alu elements Hepatitis B virus Virus integration Carcinoma,hepatocellular DNA,viral
目的 了解肝细胞癌(HCC)中HBV DNA的整合情况.方法 收集24例HBsAg阳性患者的HCC组织,提取其DNA,应用套式PCR原理,在设计的引物中引入U碱基,根据已知基因序列和人Alu重复序列分别设计引物,建立克隆整合的HBV DNA及其相邻的细胞基因序列的PCR技术.PCR产物测序所获结果经美国国家生物技术信息中心(NCBI)BLAST及Map Viewer检索确定HBV整合在染色体上的精确位置.结果 24份HCC组织中,14份存在HBV整合现象,整合的标本中11份正向插入宿主基因,8份反向插入宿主基因,其中5份标本既有正向插入也有反向插入,从病毒基因分析,整合可发生于X基因的任何长度,且均以截短形式插入宿主细胞DNA.另有8份标本未测到整合.结论 HBV在HCC细胞染色体上的整合呈不均衡分布.