目的 了解2010年上海地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株VP1区基因特征.方法 选取2010年不同时间的轻症与重症病例EV71分离株18株,对其抗原决定簇部位VP1区进行核苷酸序列测定、比对,并与美国国立生物技术信息中心公布的EV71 A、B、C各基因型分离株序列进行比对,构建系统发生树.结果 上海地区18株病毒分离株与A、B基因型参考毒株的核苷酸同源性分别为81.5％～82.6％、83.4％～84.2％,氨基酸同源性分别为94.3％～95.0％、96.6％～97.0％,与C基因型比较,核苷酸与氨基酸同源性分别为87.4％～99.2％与98.7％～100.0％.而与2008年安徽省阜阳市的EV71流行株(C4亚型)的核苷酸同源性可达97.8％～99.2％,氨基酸同源性99.3％～100.0％.在系统发生树上,这18株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支.重症病例与轻症病例EV71分离株在VP1基因区并无明显差异.结论 上海地区手足口病患者中分离的EV71流行株应属C基因型的C4亚型.
作者：朱雯；居丽雯；蒋露芳；熊海燕；汪千力；姜庆五
来源：中华传染病杂志 2011 年 29卷 10期
