目的 通过与人类全基因组寡核苷酸微阵列杂交及分析,筛查季节性变应性鼻炎(seasonal allergic rhinitis,SAR)与SAR合并哮喘患者鼻黏膜的差异基因表达谱.方法 分别取5例SAR及4例SAR合并哮喘患者的下鼻甲黏膜,提取总RNA,合成生物素标记的cRNA探针,与美国Affymetrix公司人类全基因组寡核苷酸微阵列HG-U133-plus2杂交,并以反转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerse chian reaction,RT-PCR)验证芯片结果.采用GeneSprin7.3软件分析基因表达数据,对差异基因进行基因本体论分类和生物通路注释.结果 在38 500多个基因(47 000个转录本)中,SAR合并哮喘者,其鼻黏膜发生2倍以上差异表达的基因共有1 900个,其中849个基因表达上调,1 051个表达下调.这些基因功能主要与细胞代谢、基因转录、细胞增殖、信号转导、免疫应答、多种酶活性、膜受体结合活性、细胞结构蛋白活性等有关.生物通路分成161类,其中包含20个基因以上的通路有:细胞因子受体间相互作用,局部黏附,细胞黏附分子,细胞骨架肌动蛋白调节,细胞间信号传递,缝隙连接,促分裂原活化蛋白激酶信号传导通路,钙相关信号传导通路,白细胞跨膜转运以及嘌呤代谢等生物通路.结论 SAR及SAR合并哮喘存在多基因表达调控的改变,对其差异表达基因的研究有助于阐明变应
作者:薛金梅;赵长青;赵海亮;梁爱华;解军
来源:中华耳鼻咽喉头颈外科杂志 2007 年 42卷 9期