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目的 采用基因芯片技术研究高转移卵巢上皮性癌(卵巢癌)细胞株HO-8910PM和正常卵巢上皮组织基因表达谱的差异表达基因及其与染色体拷贝数变异的相关性.方法 利用全基因组表达谱芯片、单核苷酸多态性(SNP)扫描芯片分别检测高转移卵巢癌和正常卵巢上皮组织之间的差异表达基因以及染色体拷贝数变异情况,并采用生物信息学方法对检测结果进行相关性分析.筛选部分染色体片段和差异表达基因,用荧光原位杂交技术和实时荧光定量PCR技术进行验证.结果 通过对表达谱芯片和SNP扫描芯片整合分析显示,高转移卵巢癌细胞中有379个SNP位点,共385个差异表达基因(其中有6个SNP位点发现各有2个基因).这些SNP位点染色体拷贝数扩增的有240个,缺失的有139个.染色体定位分析发现,385个差异表达基因散在分布于各条染色体上,其中3号染色体最多,有34个(占8.8

作者:应莉莎;许沈华;苏丹;牟瀚舟;顾琳慧;朱赤红;刘祥麟

来源:中华妇产科杂志 2009 年 44卷 2期

知识库介绍

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作者:
应莉莎;许沈华;苏丹;牟瀚舟;顾琳慧;朱赤红;刘祥麟
来源:
中华妇产科杂志 2009 年 44卷 2期
标签:
卵巢肿瘤 细胞系 肿瘤 寡核苷酸序列分析 基因表达谱 多态性 单核苷酸 染色体 Ovarian neoplasms Cell line,tumor Oligonucleotide array sequence analysis Gene expression profiling Polymorphism,single nucleotide Chromosomes
目的 采用基因芯片技术研究高转移卵巢上皮性癌(卵巢癌)细胞株HO-8910PM和正常卵巢上皮组织基因表达谱的差异表达基因及其与染色体拷贝数变异的相关性.方法 利用全基因组表达谱芯片、单核苷酸多态性(SNP)扫描芯片分别检测高转移卵巢癌和正常卵巢上皮组织之间的差异表达基因以及染色体拷贝数变异情况,并采用生物信息学方法对检测结果进行相关性分析.筛选部分染色体片段和差异表达基因,用荧光原位杂交技术和实时荧光定量PCR技术进行验证.结果 通过对表达谱芯片和SNP扫描芯片整合分析显示,高转移卵巢癌细胞中有379个SNP位点,共385个差异表达基因(其中有6个SNP位点发现各有2个基因).这些SNP位点染色体拷贝数扩增的有240个,缺失的有139个.染色体定位分析发现,385个差异表达基因散在分布于各条染色体上,其中3号染色体最多,有34个(占8.8