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目的 利用基因表达谱芯片,寻找有意义的差异表达基因,从而探讨喉癌发生的分子生物学机制.方法 采用Illumina人类全基因组表达谱芯片检测10对喉癌及癌旁组织的基因表达情况.提取总RNA,反转录成cDNA,将标记的cDNA与基因表达谱芯片杂交,最后读取数据及获取图像,所有样品均通过质控检测.结果 采用Illumina Genomstudio1.9.0软件数据处理(P<0.05或差异分值> 13,差异分值<-13),多重置换t检验校正(假阳性率<0.05),喉癌组织及癌旁组织的比较分析发现,在喉癌组织中差异表达的基因共有426个(上调222个,下调204个),主要参与调节细胞周期和增殖、染色体分离、细胞的有丝分裂和减数分裂等,同时也参与了多条与肿瘤发生相关的信号通路,例如:代谢通路、细胞周期、谷胱甘肽代谢、黏蛋白O多糖生物合成、药物代谢细胞色素P450等.结论 通过癌组织和癌旁组织的差异表达研究,筛选出相关基因,并对其功能及定位信息进一步分析,从多基因相互作用的角度探究喉鳞状细胞癌的发生发展机制.

作者:王茹;马泓智;廉猛;杨帆;王鸿;冯凌;房居高

来源:中华耳鼻咽喉头颈外科杂志 2014 年 49卷 3期

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作者:
王茹;马泓智;廉猛;杨帆;王鸿;冯凌;房居高
来源:
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志 2014 年 49卷 3期
标签:
寡核苷酸序列分析 喉肿瘤 基因表达谱 Oligonucleotide array sequence analysis Gene expression profiling
目的 利用基因表达谱芯片,寻找有意义的差异表达基因,从而探讨喉癌发生的分子生物学机制.方法 采用Illumina人类全基因组表达谱芯片检测10对喉癌及癌旁组织的基因表达情况.提取总RNA,反转录成cDNA,将标记的cDNA与基因表达谱芯片杂交,最后读取数据及获取图像,所有样品均通过质控检测.结果 采用Illumina Genomstudio1.9.0软件数据处理(P<0.05或差异分值> 13,差异分值<-13),多重置换t检验校正(假阳性率<0.05),喉癌组织及癌旁组织的比较分析发现,在喉癌组织中差异表达的基因共有426个(上调222个,下调204个),主要参与调节细胞周期和增殖、染色体分离、细胞的有丝分裂和减数分裂等,同时也参与了多条与肿瘤发生相关的信号通路,例如:代谢通路、细胞周期、谷胱甘肽代谢、黏蛋白O多糖生物合成、药物代谢细胞色素P450等.结论 通过癌组织和癌旁组织的差异表达研究,筛选出相关基因,并对其功能及定位信息进一步分析,从多基因相互作用的角度探究喉鳞状细胞癌的发生发展机制.