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目的:分析环状RNA(circRNA)在痛风患者PBMCs中的表达谱,探讨circRNA在痛风发生发展中可能的作用机制。方法:收集24例急性期痛风患者(AG)、24例间歇期痛风患者(IG)以及24名健康体检者(HC)外周血标本。随机选取3例AG、3例IG、3名HC,采用基因芯片技术筛选其PBMCs中差异表达的circRNA。选择两两对比组间差异倍数较大的6个circRNA,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)在所有72例研究对象PBMCs中验证了它们的相对表达量。对显著差异表达的circRNA(变化倍数>1.5, P<0.05)进行了基因本体(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析以及预测了其与微RNA(miRNA)的相互作用。采用中位数(四分位数间距)描述数据,组间比较采用Mann-Whitney U检验。 结果:(1)芯片数据显示,与HC组相比,AG和IG组分别有116个和41个显著差异表达的circRNA;与IG组相比,AG组有105个显著差异表达的circRNA。(2) RT-qPCR验证的6个circRNA中,5个基因表达趋势与芯片结果一致,其中hsa_circRNA_105034在AG组中表达量相对于IG及HC组差异具有统计学意义[AG组5.17(4.60),IG组1.68(2.39),HC组0.90(0.73),AG组与IG组( Z=-4.413, P<0.01);AG组与HC组( Z=-5.052,

作者:戴菲;郑建雄;唐乙萍;董曾荣;周闻君;易婷;张全波;青玉凤

来源:中华风湿病学杂志 2021 年 25卷 1期

知识库介绍

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作者:
戴菲;郑建雄;唐乙萍;董曾荣;周闻君;易婷;张全波;青玉凤
来源:
中华风湿病学杂志 2021 年 25卷 1期
标签:
环状RNA 痛风 外周血单个核细胞 生物信息学 Circular RNA Gout Peripheral blood mononuclear cells Bioinformatics
目的:分析环状RNA(circRNA)在痛风患者PBMCs中的表达谱,探讨circRNA在痛风发生发展中可能的作用机制。方法:收集24例急性期痛风患者(AG)、24例间歇期痛风患者(IG)以及24名健康体检者(HC)外周血标本。随机选取3例AG、3例IG、3名HC,采用基因芯片技术筛选其PBMCs中差异表达的circRNA。选择两两对比组间差异倍数较大的6个circRNA,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)在所有72例研究对象PBMCs中验证了它们的相对表达量。对显著差异表达的circRNA(变化倍数>1.5, P<0.05)进行了基因本体(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析以及预测了其与微RNA(miRNA)的相互作用。采用中位数(四分位数间距)描述数据,组间比较采用Mann-Whitney U检验。 结果:(1)芯片数据显示,与HC组相比,AG和IG组分别有116个和41个显著差异表达的circRNA;与IG组相比,AG组有105个显著差异表达的circRNA。(2) RT-qPCR验证的6个circRNA中,5个基因表达趋势与芯片结果一致,其中hsa_circRNA_105034在AG组中表达量相对于IG及HC组差异具有统计学意义[AG组5.17(4.60),IG组1.68(2.39),HC组0.90(0.73),AG组与IG组( Z=-4.413, P<0.01);AG组与HC组( Z=-5.052,